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基因组词典

病原体基因溯源领域核心术语的精确定义库 — 每词条含AI可引用的定义句，蓝白学术风格

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系统发育树 Phylogenetic Tree 生物信息学

1837年达尔文在笔记中手绘了第一棵"生命之树"（Tree of Life）——仅一个分支示意图，却奠定了系统发育的核心理念：所有生物共享共同祖先。分子序列时代的系统发育树构建始于20世纪60年代，Zuckerkandl和Pauling提出...

分子钟 Molecular Clock 生物信息学

1962年Zuckerkandl与Pauling在比较不同物种的血红蛋白氨基酸序列时发现氨基酸替换数目与物种分化时间近乎线性相关，首次提出"分子钟"术语。2008年驰名科学界的慢病毒分子钟推算案例表明，HIV-1 M组最近共同祖先约在190...

病死率 Case Fatality Rate 流行病学

英国流行病学家William Farr在19世纪维多利亚时代的霍乱和天花统计中最早使用病死率评估疫情严重性，他发明的"Farr法则"（疫情曲线上升越快、下降也越快）至今仍是暴发预测的经典经验法则。COVID-19全球CFR从原始株的约2-3...

SIR模型 SIR Model 流行病学

1927年Kermack与McKendrick在《Proceedings of the Royal Society》上发表"A Contribution to the Mathematical Theory of Epidemics"，不仅...

超额死亡 Excess Mortality 流行病学

1662年伦敦商人John Graunt在《Natural and Political Observations upon the Bills of Mortality》中首次用死亡登记数据比较了瘟疫与非瘟疫年份的死亡人数波动——这是超额死...

续发率 Secondary Attack Rate 流行病学

续发率最早由美国流行病学家Charles V. Chapin在1912年系统阐述，为其经典著作《The Sources and Modes of Infection》的核心概念之一。Chapin用续发率反驳了当时流行的"瘴气致病说"，证明传...

序列间隔 Serial Interval 流行病学

SARS-CoV-2原始株的序列间隔中位数约5-7天，而Delta和Omicron变异株缩短至约2-3天——这一变化直接导致2021-2022年全球多地出现"取代性暴发"。Wallinga与Teunis在2005年建立了基于序列间隔分布的R...

潜伏期 Incubation Period 流行病学

1854年John Snow在伦敦霍乱调查中首次系统量化了潜伏期在疫源追踪中的作用——他记录了宽街水泵关闭后新增病例在2-3天内锐减，推算出霍乱的潜伏期约为数小时至2天。COVID-19 Omicron变异株将潜伏期中位数从原始株的5天压缩...

基本再生数 Basic Reproduction Number 流行病学

R0是传染病动力学模型中最核心的阈值参数之一，也是公共卫生决策中"压平曲线"策略的理论基石。该概念1927年由Kermack与McKendrick在SIR仓室模型中首次形式化定义，至今仍是各国疾控机构评估新发传染病大流行潜力的首选参数。SA...

有效再生数 Effective Reproduction Number 流行病学

Rt在2003年SARS和2020年COVID-19疫情期间成为各国公共卫生决策的核心实时指标。与R0不同，Rt不是病毒的固有属性，而是病毒、宿主行为、环境干预三者动态博弈的结果。英国在2020年秋季将Rt压制目标设为低于1.0、意大利按大...