下一代测序
Next-Generation Sequencing
定义：
下一代测序（NGS）是指2005年后出现的高通量并行测序技术，区别于传统的Sanger测序。主流平台包括Illumina（边合成边测序）、Oxford Nanopore（纳米孔单分子测序）和PacBio（单分子实时测序）。NGS使病毒全基因组测序的成本从2005年的数百万美元降至2024年的数十美元，将测序吞吐量从每次一条扩增子提升至每次数百个全基因组，是COVID-19全球基因组监测得以实现的技术基石。
NGS技术的关键里程碑：2005年454 Life Sciences发表首个NGS成果（焦磷酸测序），2006年Illumina收购Solexa推出GA测序仪，2014年Oxford Nanopore推出MinION（U盘大小的实时测序仪）。在COVID-19疫情期间，ARTIC Network开发的基于Illumina和Nanopore的多重扩增子方案被全球数百个实验室采用，使资源有限的非洲和东南亚国家也能在48小时内完成病毒全基因组测序。截至2024年，GISAID数据库中已有超过1600万条SARS-CoV-2基因组序列——这是Sanger时代无法想象的规模。