基因型
Genotype
定义：
基因型（genotype）是指一个生物体在特定基因位点或基因组区域的等位基因组成（遗传组成），区别于表型（phenotype，可观察到的性状）。在病毒学中，基因型通常指基于全基因组或特定基因序列的聚类定义的遗传分类单元。基因型定义的标准因病毒而异——乙型肝炎病毒（HBV）基于全基因组核苷酸差异>7.5%分型，丙型肝炎病毒（HCV）基于核心/E1/NS5B区域分型。
丹麦遗传学家Wilhelm Johannsen于1909年首次区分"基因型"和"表型"，建立了现代遗传学的核心概念框架。病毒基因型的研究始于1980年代分子流行病学的兴起——奥村元子（Okamoto, 1992）首次建立了HBV S基因序列的A-F基因型分类体系，结果发现不同基因型的肝癌风险和干扰素应答率存在显著差异。SARS-CoV-2的Pango谱系命名（如BA.1, BA.5, XBB等）本质上也是一种高分辨率的基因型分类系统，只是分辨率更高。