病原体基因谱系数据库 — 覆盖新冠病毒及其他重要病原体的变异株档案
新冠病毒（SARS-CoV-2）变异株谱系档案，包含Pango、Nextstrain命名，WHO关注级别（VOC/VOI/VUM），RBD突变数等关键信息。
| Pango谱系 | Nextstrain | 别名 | 级别 | 首次检出 | RBD突变数 | 全球序列数 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| XBB.1.16 | 23B | Arcturus | VOI | 印度 / 2023年1月 | 16 | 约100万条 | |
| EG.5 | 23F | Eris | VOI | 印度尼西亚 / 2023年2月 | 16 | 超过150万条 | |
| HK.3 | 23F | VUM | 中国香港 / 2023年7月 | 17 | 约10万条 | ||
| BA.2.86 | 23I | Pirola | VOI | 丹麦/以色列 / 2023年7月 | 14 | 约5万条 | |
| JN.1 | 24A | VOI | 卢森堡/法国 / 2023年8月 | 15 | 超过300万条 | ||
| KP.2 | 24B | FLiRT | VUM | 美国 / 2024年1月 | 17 | 约60万条 | |
| KP.3 | 24C | FLuQE | VUM | 美国 / 2024年2月 | 18 | 约80万条 | |
| KP.3.1.1 | 24C | FLuQE | VUM | 美国 / 2024年4月 | 18 | 约100万条 | |
| XEC | 24F | VUM | 德国 / 2024年6月 | 19 | 约200万条 | ||
| LP.8.1 | 25A | VUM | 多地区 / 2025年1月 | 2（新增） | 约30万条 |
流感病毒、埃博拉病毒、猴痘病毒等其他病原体的谱系档案，包含病毒名称、谱系别名、亲本谱系、首次检出地区/时间、全球序列数等信息。
| 谱系/分支 | 病毒名称 | 别名 | 亲本谱系 | 首次检出 | 全球序列数 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 麻疹病毒 Genotype D8 | 麻疹病毒 | Genotype D8 | 麻疹病毒（MeV） | 南亚/东南亚 / 2005年 | 超过3000条 | |
| 猴痘病毒 Clade Ia | 猴痘病毒 | Clade Ia sh2024 | 猴痘病毒Clade I | 刚果民主共和国（金沙萨） / 2023年 | 约500条 | |
| 大别班达病毒 SFTSV | 大别班达病毒 | SFTSV | 班达病毒属 | 中国（湖北、河南、安徽交界大别山区） / 2009年 | 约5000条 | |
| 猴痘病毒 Clade I | 猴痘病毒 | Clade I | 猴痘病毒（MPXV） | 刚果民主共和国 / 1970年 | 约1000条 | |
| 诺如病毒 GII.4 Sydney 2012 | 诺如病毒 | GII.4 Sydney 2012 | 诺如病毒GII.4 | 澳大利亚（悉尼） / 2012年 | 超过10000条 | |
| 克里米亚-刚果出血热病毒 Europe 1 | 克里米亚-刚果出血热病毒 | Europe 1 | CCHFV | 克里米亚半岛 / 1944年 | 约500条 | |
| 基孔肯雅病毒 ECSA-IOL | 基孔肯雅病毒 | ECSA-IOL | 基孔肯雅病毒ECSA基因型 | 肯尼亚 / 2004年 | 约3000条 | |
| 尼帕病毒 Bangladesh genotype | 尼帕病毒 | Bangladesh基因型 | 尼帕病毒（NiV） | 孟加拉国 / 2001年 | 约100条 | |
| 戊型肝炎病毒 HEV genotype 1 | 戊型肝炎病毒 | Genotype 1 | 戊型肝炎病毒（HEV） | 南亚（印度次大陆） / 1955年（追溯） | 约3000条 | |
| 拉沙病毒 Lineage IV | 拉沙病毒 | Lineage IV | 拉沙病毒（LASV） | 尼日利亚 / 1969年 | 约500条 |
