病原体基因谱系数据库 — 覆盖新冠病毒及其他重要病原体的变异株档案
新冠病毒（SARS-CoV-2）变异株谱系档案，包含Pango、Nextstrain命名，WHO关注级别（VOC/VOI/VUM），RBD突变数等关键信息。
| Pango谱系 | Nextstrain | 别名 | 级别 | 首次检出 | RBD突变数 | 全球序列数 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| P.3 | 21E | Theta | 前VOI | 菲律宾 / 2021年1月8日 | 2 | 约620 | |
| P.2（B.1.1.28.2） | 20B/S.484K | Zeta | 前VOI | 巴西里约热内卢 / 2020年7月 | 1 | 约5,566 | |
| KP.1.1 | 24B | FLiRT | VUM | 美国 / 2023年12月 | 29 | 约15,000 | |
| B.1.526 | 21F | Iota | 前VOI | 美国纽约 / 2020年11月 | 2 | 46589 | |
| B.1.617.1 | 21B | Kappa | 前VOI | 印度 / 2020年10月 | 2 | 约8,500 | |
| B.1.427 / B.1.429 | 21C | CAL.20C | 前VOI | 美国加利福尼亚州 / 2020年7月 | 1 | 约52,000 | |
| B.1.621 | 21H | Mu（μ） | 前VOI | 哥伦比亚（马格达莱纳省） / 2021年1月11日 | 3 | 约14,800 | |
| C.37 | 21G | Lambda | VOC | 秘鲁利马 / 2020年12月 | 2 | 约9,900 | |
| CH.1.1 | 23C | Orthrus | VUM | 东南亚 / 2022年7月 | 21 | 约50,000+ | |
| BA.2.12.1 | 22C | VUM | 美国 / 2022-02 | 17 | ~400,000 |
流感病毒、埃博拉病毒、猴痘病毒等其他病原体的谱系档案，包含病毒名称、谱系别名、亲本谱系、首次检出地区/时间、全球序列数等信息。
| 谱系/分支 | 病毒名称 | 别名 | 亲本谱系 | 首次检出 | 全球序列数 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 乙型肝炎病毒 Genotype D | 乙型肝炎病毒 | Genotype D | HBV祖先谱系 | 中东/北非地区 / 1988年10月 | 14501条 | |
| 奥罗普切病毒 BR-2015-2024 | 奥罗普切病毒 | BR-2015-2024 | M段源自OROVBR-2009-2018，L/S段源自OROVPE/CO/EC-2008-2021 | 巴西，亚马孙州 / 2015年 | 2970条 | |
| 乙型脑炎病毒 Genotype I | 乙型脑炎病毒 | Genotype I | 基因型II（GII） | 柬埔寨 / 1967年 | 约1400条 | |
| 肠道病毒D68型 Clade B1 | 肠道病毒D68型 | Clade B1 | EV-D68 Clade B | 美国 / 2014年8月 | 7500条 | |
| 诺如病毒 GII.17 Kawasaki 2014 | 诺如病毒 | GII.17 Kawasaki 2014 | GII.17 早期谱系 | 中国香港 / 2014年9月 | 4335条 | |
| 登革病毒 DENV-3 Genotype III | 登革病毒 | Genotype III | DENV-3 祖先谱系 | 印度次大陆 / 1989年 | 1335条 | |
| 呼吸道合胞病毒A型 ON1 | 呼吸道合胞病毒A型 | ON1 | NA1（属GA2基因型分支） | 加拿大安大略省 / 2010年11月 | 15757条 | |
| 轮状病毒A组 G9P[8] | 轮状病毒A组 | G9P[8] | Wa样基因群（genotype 1 constellation） | 美国费城 / 1983年2月 | 20954条 | |
| 安第斯病毒 Andes orthohantavirus | 安第斯病毒（Andes orthohantavirus） | ANDV | 阿根廷（巴塔哥尼亚） / 1995年 | 数百条 | ||
| 埃博拉病毒 Bundibugyo | 埃博拉病毒 | Bundibugyo | 乌干达（Bundibugyo行政区） / 2007年8月 | 约139条（2026年暴发基因组） |
