宏基因组学
Metagenomics
定义：
宏基因组学（metagenomics）是指不依赖培养、直接从环境或临床样本中提取全部DNA/RNA并进行高通量测序和分析的方法。与靶向扩增子测序不同，宏基因组学能无偏好地检出样本中所有微生物的核酸序列，包括未知病原体。该技术在新型病毒发现（如SARS-CoV-2的早期鉴定）、病原体共感染分析和环境微生物组调查中具有核心价值。
1998年Handelsman等首次提出"宏基因组学"一词，意为绕过培养直接分析环境微生物群落的总基因组。2020年1月SARS-CoV-2是首个在宏基因组测序中快速鉴定的冠状病毒——武汉病毒所和复旦大学的团队分别从BALF样本中通过宏基因组学获得了完整病毒基因组，并在测序数据中排除了其他已知病原体共感染的可能。IDseq、CZ ID等开源宏基因组平台正在将这一技术推广至资源有限地区的传染病监测网络。