奥罗普切病毒 BR-2015-2024
谱系起源与命名
奥罗普切病毒（Oropouche virus, OROV）最早于1955年在特立尼达和多巴哥的Vega de Oropouche村被发现，从一名发热的林业工人血液中分离获得。此后数十年间，这个病毒在亚马逊流域反复引发疫情。截至2018年，血清学研究推算累计感染人数已超过50万。
BR-2015-2024谱系是一个全新的重配株。它的基因组由三个节段组成：M节段来自2009至2018年在巴西亚马逊东部（阿马帕州、帕拉州）流行的OROVBR-2009-2018分支，L和S节段来自2008至2021年在秘鲁、哥伦比亚和厄瓜多尔流行的OROVPE/CO/EC-2008-2021分支。重配事件很可能在2010年至2014年间发生于巴西亚马孙州。这个谱系最早的基因组序列于2015年在亚马孙州特费市（Tefé）的样本中获得。Naveca等人于2024年在《自然·医学》上通过分析382个全长基因组，正式描述了这个重配谱系，将其命名为OROVBR-2015-2024。
分子特征
奥罗普切病毒属于Peribunyaviridae科Orthobunyavirus属。基因组由三个单链负义RNA节段组成：大节段（L，约6.8 kb）编码RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp），中节段（M，约4.4 kb）编码Gn/Gc包膜糖蛋白前体和NSm非结构蛋白，小节段（S，约0.96 kb）编码核蛋白和NSs非结构蛋白。分节段基因组的特性使不同毒株共感染同一宿主细胞时可能发生节段重配，产生全新的基因组合。
BR-2015-2024最突出的分子特征是其重配来源。系统发育分析显示，M节段归入M1谱系，与OROV原型株同属一个主要分支；而L和S节段归入L2和S2谱系，与Iquitos病毒原型株的亲缘关系更近。这种M1L2S2重配组合在OROV进化史上此前未被记录。
Scachetti等人通过体外实验证明，BR-2015-2024重配株在哺乳动物细胞中的复制滴度比原型株BeAn 19991高约100倍。它的空斑出现时间更早、数量是原型株的1.7倍、空斑大小为原型株的2.5倍。这意味着病毒复制效率和细胞间扩散能力显著增强。2016年采集的既往OROV感染者血清对该重配株的中和能力下降至少32倍，提示存在一定程度的免疫逃逸。
关键突变
与亲本分支相比，BR-2015-2024重配株在M和L节段上积累了一系列非同义突变。这些氨基酸替换主要集中在Gn/Gc糖蛋白和RNA聚合酶上，可能协同促进了病毒复制效率的提升和免疫逃逸。
| 基因 | 突变 | 类型 | 功能影响 |
|---|---|---|---|
| M（Gn） | V61F | 非同义突变 | Gn包膜糖蛋白N端区域，可能改变宿主细胞受体结合特性 |
| M（NSm） | I393T | 非同义突变 | NSm非结构蛋白，参与病毒组装与出芽，可能影响复制效率 |
| M（Gc） | F/L521S | 非同义突变 | Gc糖蛋白融合环区域，可能影响膜融合活性与宿主范围 |
| M（Gc） | V526I | 非同义突变 | Gc糖蛋白，作为病毒抗受体可能改变受体识别 |
| M（Gc） | I958T | 非同义突变 | Gc糖蛋白跨膜区附近，可能影响蛋白稳定性 |
| M（Gc） | S1268P | 非同义突变 | Gc糖蛋白C端，脯氨酸引入可能改变局部构象 |
| L（RdRp） | R346K | 非同义突变 | RNA聚合酶，可能影响复制保真度与免疫逃逸 |
| L（RdRp） | H476Y | 非同义突变 | RNA聚合酶催化域附近，可能影响复制效率 |
| L（RdRp） | E847G | 非同义突变 | RNA聚合酶，可能改变酶活性与模板结合 |
| L（RdRp） | I1942V | 非同义突变 | RNA聚合酶C端区域，可能影响蛋白-蛋白相互作用 |
传播与地理扩散
BR-2015-2024谱系自2022年起在巴西亚马逊西部地区引发了有记录以来最大规模的OROV疫情。2022年8月至2024年2月间，该谱系已在亚马孙州、阿克里州、朗多尼亚州和罗赖马州检出。系统动力学重建显示，病毒扩散主要由短距离（小于2公里）移动驱动，但长距离（大于10公里）迁移事件也被检测到，这与人类活动介导的病毒播散模式一致。
2024年，扩散范围远超历史记录。截至2024年7月，巴西已有19个联邦单位报告本地感染病例，其中83.2%（6895/8284）集中在北部地区。发病率较过去十年增长了近200倍。非亚马逊地区的巴伊亚州、圣埃斯皮里图州、圣卡塔琳娜州、伯南布哥州等地首次报告了本地传播。
2024年5月，古巴报告了该国首次OROV疫情。系统发育分析确认，古巴流行株与2023年巴西流行株高度同源，同属BR-2015-2024分支。哥伦比亚也在2024年初检测到该谱系与另一OROV谱系的共流行。截至2024年8月，玻利维亚、秘鲁、哥伦比亚、古巴和多米尼加共和国均有该谱系相关病例报告。旅行相关病例在美国、加拿大、意大利、德国和西班牙被检出。短短两年之内，这个亚马逊深处的病毒就走到了北半球。
临床与公共卫生影响
OROV感染的潜伏期通常为3至10天。症状包括突发高热（38–40°C）、剧烈头痛、肌痛、关节痛、畏光、恶心呕吐和皮疹。约60%的感染者出现临床症状，病程一般2至7天。高达60%的患者在症状消失数天至数周后会再次出现症状。少数病例可发展为无菌性脑膜炎，估计约4%的患者出现神经系统症状。
2024年疫情中出现了两个前所未有的临床现象。巴西巴伊亚州报告了两例确诊死亡病例——两名无基础疾病的年轻女性（21岁和24岁），病情迅速恶化，出现严重凝血功能障碍和肝损伤，最终死亡。这是OROV首次被确认导致人类死亡。
巴西还报告了多例疑似垂直传播事件。截至2024年7月，已发现4例死产、1例自然流产，以及4例新生儿小头畸形。胎儿组织RT-PCR检出OROV RNA，同时排除了登革、寨卡、基孔肯雅等共循环虫媒病毒。调查仍在进行中。这与寨卡病毒2015至2016年在巴西的垂直传播模式有相似之处，引发了对孕期OROV感染风险的高度关注。
目前尚无针对OROV的特异性抗病毒药物或疫苗。治疗以支持性对症为主。防控依赖媒介控制和个人防护。主要传播媒介Culicoides paraensis（一种蠓虫）体型极小，标准蚊帐防护效果有限，需使用细网蚊帐和含DEET成分的驱虫剂。泛美卫生组织/世界卫生组织于2024年将OROV的公共卫生风险评估为区域高风险、全球低风险。C. paraensis的分布范围覆盖美国南部，且该谱系已扩散至古巴等加勒比人口密集地区，进一步地理扩张的可能性值得警惕。
参考文献
- Naveca FG, de Almeida TAP, Souza V, et al. Human outbreaks of a novel reassortant Oropouche virus in the Brazilian Amazon region. Nat Med. 2024;30(12):3509-3521. DOI: 10.1038/s41591-024-03300-3
- Scachetti GC, Forato J, Claro IM, et al. Re-emergence of Oropouche virus between 2023 and 2024 in Brazil: an observational epidemiological study. Lancet Infect Dis. 2025;25(2):166-175. DOI: 10.1016/S1473-3099(24)00619-4
- Gutierrez B, Wise EL, Pullan ST, et al. Evolutionary Dynamics of Oropouche Virus in South America. J Virol. 2020;94(5):e01127-19. DOI: 10.1128/JVI.01127-19
- Travassos da Rosa JF, de Souza WM, Pinheiro FP, et al. Oropouche Virus: Clinical, Epidemiological, and Molecular Aspects of a Neglected Orthobunyavirus. Am J Trop Med Hyg. 2017;96(5):1019-1030. DOI: 10.4269/ajtmh.16-0672
- Silva Júnior JVJ, Lopes TRR, Pedroso NH, et al. Unprecedented Oropouche Fever Outbreak in Brazil: Could the M Segment-Encoded Proteins Provide Clues to Possible Insights? J Med Virol. 2024;96(12):e70112. DOI: 10.1002/jmv.70112