FLiRT（KP.1.1）
关键突变
KP.1.1 在亲本 KP.1 的基础上仅新增了 1 个谱系定义突变——S:R346T。回溯其完整演化路径至 JN.1，KP.1.1 共累积了 3 处关键刺突蛋白氨基酸替换。其中 R346T 和 F456L 构成了「FLiRT」昵称的来源（F→L 在 456 位，R→T 在 346 位）。下面列出 KP.1.1 相对于 JN.1 的关键氨基酸变化。
| 基因 | 突变 | 类型 | 功能影响 |
|---|---|---|---|
| S | R346T | 错义突变（RBD） | FLiRT 标志突变（KP.1.1 谱系定义突变）；削弱 I 类中和抗体结合，增强免疫逃逸 |
| S | F456L | 错义突变（RBD） | FLiRT 标志突变（继承自 JN.1.11.1）；改变 RBD 与 ACE2 的疏水界面，降低部分抗体中和活性 |
| S | K1086R | 错义突变（S2） | 继承自 KP.1；位于 S2 亚基，对融合构象的影响尚不明确 |
注：S:K182N 和 Orf1b:L2213F 属于 KP.1.1.1（KP.1.1 的子代谱系），非 KP.1.1 自身的突变。KP.1.1 同时携带 JN.1 的全部刺突蛋白突变（包括 L455S），以及 BA.2.86 谱系积累的约 30 处刺突蛋白变异。RBD 区域合计约 29 个氨基酸替换（BA.2.86 积累约 26 个，JN.1 新增 L455S，KP.1.1 及其上游分支再叠加 F456L 和 R346T），大幅重塑了抗原表面。
命名由来
KP.1.1 属于 Pango 别名系统下的压缩命名。其完整层级路径为：B.1.1.529（Omicron）→ BA.2.86（Pirola）→ JN.1（BA.2.86.1.1）→ JN.1.11.1 → KP.1（JN.1.11.1.1）→ KP.1.1。按照 Pango 规则，当一个谱系的名称超过 4 个层级时会分配别名——「KP」即 JN.1.11.1 的别名前缀。KP.1 在此基础上新增 S:K1086R，KP.1.1 再叠加 S:R346T。KP.1.1 的子代 KP.1.1.1 进一步获得了 S:K182N 和 Orf1b:L2213F。
与亲本 KP.1 相比，KP.1.1 最关键的区别在于获得了 R346T。这个突变把它送进了 FLiRT 家族——与姐妹谱系 KP.2（JN.1.11.1.2）共享 R346T + F456L 双突变组合。两者均继承自 JN.1.11 分支的 V1104L（S2 亚基），但 KP.1.1 额外携带 K1086R（来自 KP.1），KP.2 则无此突变。正是 R346T 的出现使 KP.1.1 从普通 JN.1 子代中脱颖而出，具备了更强的抗体逃逸潜力。
特征解读
KP.1.1 是 FLiRT 家族中第一个被正式命名的成员（2024 年 3 月 4 日获得 Pango 指定），比 KP.2 早数周进入监测视野。它的核心特征可以概括为：在 JN.1 已建立的强免疫逃逸基底上，通过 R346T + F456L 双突变进一步瓦解残余中和抗体屏障。
值得关注的原因有三。其一，R346T 和 F456L 位于 RBD 的 I 类抗体表位热点区域，两个位点协同作用使 KP.1.1 对二价疫苗免疫血清和 BA.2.86/JN.1 突破感染恢复期血清的中和敏感性显著下降。其二，虽然 KP.1.1 的全球占比从未超过 KP.2，但它的出现标志着 JN.1 谱系进入「多位点精细调优」阶段——不同子代在相同关键位点（346、456）反复获得趋同突变，说明这些位置存在持续的免疫选择压力。其三，KP.1.1 衍生出了自己的子代（如 KP.1.1.1、LP.8.1），在后续流行中继续演化，其中 LP.8.1 在 2024 年末至 2025 年成为重要监测对象。
与姐妹谱系 KP.2 的差异：两者均携带 V1104L（S2 亚基，继承自 JN.1.11），但 KP.1.1 额外具有 K1086R（继承自 KP.1），KP.2 无此突变。KP.1.1 的子代 KP.1.1.1 获得了 S:K182N（NTD）和 Orf1b:L2213F，使 NTD 抗原表面进一步改变。体外实验显示 KP.1.1 的免疫逃逸能力与 KP.2 相近，但在真实世界中的传播 fitness 低于 KP.2，这可能是 KP.2 最终成为 FLiRT 主导谱系的原因之一。
全球分布
KP.1.1 于 2023 年 12 月在美国首次检出，随后扩散至多个国家和地区。以下为 2024 年 3 月至 6 月期间基于 GISAID 提交数据的主要分布概况。
| 地区/国家 | 序列数（估算） | 占当地比例（峰值） | 趋势 |
|---|---|---|---|
| 美国 | 约 7,000 | ~7.5% | 2024 年 4 月达峰后缓慢下降 |
| 英国 | 约 1,200 | ~3% | 低水平持续检出 |
| 印度 | 约 800 | ~2% | 零星检出 |
| 加拿大 | 约 600 | ~4% | 与美国同步波动 |
| 澳大利亚 | 约 400 | ~3% | 输入性为主 |
| 新加坡 | 约 200 | ~2% | 散发 |
| 其他（土耳其、阿根廷、新西兰等） | 合计约 1,000 | <2% | 零星检出，未形成持续传播链 |
美国始终是 KP.1.1 的绝对主力疫区。到 2024 年 4 月底，KP.1.1 在美国新发病例中的占比约为 7.5%，而同期其姐妹谱系 KP.2 已达到约 25%。KP.1.1 从未成为任何国家的主导变异株，随着 KP.3 和后续 LP.8.1 等子代的崛起，KP.1.1 在全球范围内的检出比例在 2024 年夏季后快速萎缩。
传播力评估
相对增长优势：KP.1.1 的有效繁殖数（Re）估计比 JN.1 高出约 1.2 倍，但这种增长优势远逊于 KP.2（约 1.4 倍）。在与其他 JN.1 子代的竞争中，KP.1.1 未能展现出足以取代 KP.2 的传播 fitness。
免疫逃逸能力：多项中和实验一致表明，KP.1.1 对各类免疫血清的逃逸能力强于 JN.1。Xu 等人 2024 年在 npj Vaccines 发表的数据显示，KP.1.1 对 BF.7/BA.5.2 突破感染者和二价疫苗（Delta/BA.5）加强接种者血清的中和滴度较 JN.1 进一步降低，逃逸幅度与 KP.2 接近但略弱于 KP.3。不过，经历过 XBB 亚变种二次突破感染的个体对 KP.1.1 仍保留一定的中和活性。
临床严重性：现有证据未表明 KP.1.1 相对于其他 Omicron 子代导致更严重的临床结局。致病性评估主要基于其亲本 JN.1 的数据——JN.1 谱系整体保持了 Omicron 相对于 Delta 较低的下呼吸道致病特征。目前没有 KP.1.1 特异性住院率或重症率上升的报告。公共卫生关注重点仍落在其免疫逃逸特性对疫苗保护效力的削弱上，而非毒力变化。
参考文献
- Kumar P, Jayan J, Sharma RK, Gaidhane AM, Zahiruddin QS, Rustagi S, Satapathy P. The emerging challenge of FLiRT variants: KP.1.1 and KP.2 in the global pandemic landscape. QJM: An International Journal of Medicine. 2024;117(7):485-487. DOI: 10.1093/qjmed/hcae102
- Li P, Faraone JN, Hsu CC, Chamblee M, Zheng YM, Carlin C, Bednash JS, Horowitz JC, Mallampalli RK, Saif LJ, Oltz EM, Jones D, Li J, Gumina RJ, Xu K, Liu SL. Neutralization escape, infectivity, and membrane fusion of JN.1-derived SARS-CoV-2 SLip, FLiRT, and KP.2 variants. Cell Reports. 2024;43(8):114520. DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114520
- Xu K, An Y, Liu X, Xie H, Li D, Yang T, Duan M, Wang Y, Zhao X, Dai L, Gao GF. Neutralization of SARS-CoV-2 KP.1, KP.1.1, KP.2 and KP.3 by human and murine sera. npj Vaccines. 2024;9(1):215. DOI: 10.1038/s41541-024-01016-6