非新冠病毒的病原体谱系档案 — 覆盖流感病毒、埃博拉病毒、猴痘病毒等，每行含简要关键信息
| 谱系/分支 | 病毒名称 | 别名 | 亲本谱系 | 首次检出 | 全球序列数 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 人类免疫缺陷病毒 HIV-1 B亚型 | 人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1） | B亚型 | HIV-1 M组 | 法国巴黎 / 1983年5月 | 327145条 | |
| 寨卡病毒 African lineage | 寨卡病毒 | African lineage | 寨卡病毒祖先谱系（与Asian lineage的共同祖先） | 乌干达恩德培附近Ziika森林 / 1947年4月 | 7条 | |
| 登革病毒 DENV-4 Genotype I | 登革病毒 | Genotype I | DENV-4（登革病毒4型） | 菲律宾 / 1956年 | 302条 | |
| 基孔肯雅病毒 Asian lineage | 基孔肯雅病毒 | Asian lineage | 非洲来源的祖先谱系（约70至90年前传入亚洲） | 泰国曼谷 / 1958年 | 49条 | |
| 登革病毒 DENV-1 Genotype V | 登革病毒 | Genotype V | 登革病毒 1 型（DENV-1） | 美洲加勒比地区 / 1977 | 739条 | |
| 流感病毒 H9N2 G1谱系 | 流感病毒 | G1谱系 | 欧亚禽源H9N2谱系（h9.4支系） | 中国香港 / 1997年 | 70157条（GenBank H9N2相关核苷酸记录，检索于2026-08-18） | |
| 丙型肝炎病毒 Genotype 1b | 丙型肝炎病毒 | Genotype 1b | 丙型肝炎病毒基因1型（Genotype 1） | 日本 / 1990年 | 23981条 | |
| 乙型肝炎病毒 Genotype D | 乙型肝炎病毒 | Genotype D | HBV祖先谱系 | 中东/北非地区 / 1988年10月 | 14501条 | |
| 奥罗普切病毒 BR-2015-2024 | 奥罗普切病毒 | BR-2015-2024 | M段源自OROVBR-2009-2018，L/S段源自OROVPE/CO/EC-2008-2021 | 巴西，亚马孙州 / 2015年 | 2970条 | |
| 乙型脑炎病毒 Genotype I | 乙型脑炎病毒 | Genotype I | 基因型II（GII） | 柬埔寨 / 1967年 | 约1400条 | |
| 肠道病毒D68型 Clade B1 | 肠道病毒D68型 | Clade B1 | EV-D68 Clade B | 美国 / 2014年8月 | 7500条 | |
| 诺如病毒 GII.17 Kawasaki 2014 | 诺如病毒 | GII.17 Kawasaki 2014 | GII.17 早期谱系 | 中国香港 / 2014年9月 | 4335条 | |
| 登革病毒 DENV-3 Genotype III | 登革病毒 | Genotype III | DENV-3 祖先谱系 | 印度次大陆 / 1989年 | 1335条 | |
| 呼吸道合胞病毒A型 ON1 | 呼吸道合胞病毒A型 | ON1 | NA1（属GA2基因型分支） | 加拿大安大略省 / 2010年11月 | 15757条 | |
| 轮状病毒A组 G9P[8] | 轮状病毒A组 | G9P[8] | Wa样基因群（genotype 1 constellation） | 美国费城 / 1983年2月 | 20954条 | |
| 安第斯病毒 Andes orthohantavirus | 安第斯病毒（Andes orthohantavirus） | ANDV | 阿根廷（巴塔哥尼亚） / 1995年 | 数百条 | ||
| 埃博拉病毒 Bundibugyo | 埃博拉病毒 | Bundibugyo | 乌干达（Bundibugyo行政区） / 2007年8月 | 约139条（2026年暴发基因组） | ||
| 狂犬病毒 基因型1 | 狂犬病毒 | 基因型1 | 弹状病毒科 | 全球（除南极洲） / 公元前2300年（最早记录） | 约1150条/年 | |
| 脊髓灰质炎病毒 WPV1 | 脊髓灰质炎病毒 | WPV1 | 肠道病毒C种 | 全球（目前仅阿富汗、巴基斯坦流行） / 1908年 | 约330条/年 | |
| 猴痘病毒 Clade IIa | 猴痘病毒 | Clade IIa | 猴痘病毒祖先株 | 西非 / 20世纪70年代 | 约5000条（GISAID） |
