非新冠病毒的病原体谱系档案 — 覆盖流感病毒、埃博拉病毒、猴痘病毒等，每行含简要关键信息
| 谱系/分支 | 病毒名称 | 别名 | 亲本谱系 | 首次检出 | 全球序列数 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 基孔肯雅病毒 ECSA-IOL | 基孔肯雅病毒 | ECSA-IOL | 基孔肯雅病毒ECSA基因型 | 肯尼亚 / 2004年 | 约3000条 | |
| 尼帕病毒 Bangladesh genotype | 尼帕病毒 | Bangladesh基因型 | 尼帕病毒（NiV） | 孟加拉国 / 2001年 | 约100条 | |
| 戊型肝炎病毒 HEV genotype 1 | 戊型肝炎病毒 | Genotype 1 | 戊型肝炎病毒（HEV） | 南亚（印度次大陆） / 1955年（追溯） | 约3000条 | |
| 拉沙病毒 Lineage IV | 拉沙病毒 | Lineage IV | 拉沙病毒（LASV） | 尼日利亚 / 1969年 | 约500条 | |
| 汉滩病毒 汉滩型 | 汉滩病毒 | 汉滩型（HTNV） | 汉坦病毒属 | 韩国/中国 / 1978年 | 约2000条 | |
| 人类免疫缺陷病毒 CRF01_AE | 人类免疫缺陷病毒 | CRF01_AE | HIV-1 A亚型/E亚型重组 | 中非共和国 / 1970年代 | 超过50000条 | |
| 人类免疫缺陷病毒 CRF02_AG | 人类免疫缺陷病毒 | CRF02_AG | HIV-1 A亚型/G亚型重组 | 西非/中非 / 1970年代 | 超过40000条 | |
| 乙型肝炎病毒 HBV genotype C | 乙型肝炎病毒 | Genotype C | 乙肝病毒（HBV） | 东亚/东南亚 / 1970年代定型 | 超过50000条 | |
| 西尼罗病毒 WN02 | 西尼罗病毒 | WN02 | WNV lineage 1a (NY99) | 美国 / 2001年 | 约10000条 | |
| 人类免疫缺陷病毒 HIV-1 C亚型 | 人类免疫缺陷病毒 | HIV-1 C亚型 | HIV-1 M组 | 刚果民主共和国姆布吉马伊 / 1950年代 | 超过100000条 | |
| 流感病毒 B/Victoria | 流感病毒 | B/Victoria | 乙型流感病毒 | 加拿大 / 1985年 | 超过100000条 | |
| 雷斯顿埃博拉病毒 Reston | 雷斯顿埃博拉病毒 | Reston | 埃博拉病毒属 | 美国弗吉尼亚州（自菲律宾进口猕猴） / 1989年 | 约20条 | |
| 黄热病病毒 West Africa I | 黄热病病毒 | West Africa I | 黄热病病毒（非洲株） | 西非（尼日利亚、塞内加尔） / 1927年 | 约500条 | |
| 苏丹埃博拉病毒 Mubende | 苏丹埃博拉病毒 | Mubende | 苏丹埃博拉病毒（SUDV）Nakisamata株 | 乌干达穆本德区 / 2022年9月 | 约50条 | |
| 马尔堡病毒 Angola | 马尔堡病毒 | Angola | 马尔堡病毒（MARV） | 安哥拉威热省 / 2004年10月 | 约30条 | |
| 中东呼吸综合征冠状病毒 MERS-CoV | 中东呼吸综合征冠状病毒 | MERS-CoV | 蝙蝠冠状病毒HKU4/HKU5 | 沙特阿拉伯 / 2012年6月 | 约2000条 | |
| 寨卡病毒 Asian lineage | 寨卡病毒 | Asian lineage | 寨卡病毒（非洲株） | 密克罗尼西亚雅浦岛 / 2007年 | 约5000条 | |
| 流感病毒 H7N9 | 流感病毒 | H7N9 | H7N3/H9N2重配 | 中国上海/安徽 / 2013年3月 | 约2000条 | |
| 流感病毒 H3N2 3C.2a | 流感病毒 | H3N2 3C.2a | H3N2 3C | 全球 / 2014年 | 超过500000条 | |
| 流感病毒 H1N1 pdm09 | 流感病毒 | H1N1 pdm09 | 经典猪H1N1 / 欧亚禽样猪H1N1 | 墨西哥/美国 / 2009年3月 | 超过250000条 |
