非新冠病毒的病原体谱系档案 — 覆盖流感病毒、埃博拉病毒、猴痘病毒等，每行含简要关键信息
| 谱系/分支 | 病毒名称 | 别名 | 亲本谱系 | 首次检出 | 全球序列数 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 马尔堡病毒 Angola | 马尔堡病毒 | Angola | 马尔堡病毒（MARV） | 安哥拉威热省 / 2004年10月 | 约30条 | |
| 中东呼吸综合征冠状病毒 MERS-CoV | 中东呼吸综合征冠状病毒 | MERS-CoV | 蝙蝠冠状病毒HKU4/HKU5 | 沙特阿拉伯 / 2012年6月 | 约2000条 | |
| 寨卡病毒 Asian lineage | 寨卡病毒 | Asian lineage | 寨卡病毒（非洲株） | 密克罗尼西亚雅浦岛 / 2007年 | 约5000条 | |
| 流感病毒 H7N9 | 流感病毒 | H7N9 | H7N3/H9N2重配 | 中国上海/安徽 / 2013年3月 | 约2000条 | |
| 流感病毒 H3N2 3C.2a | 流感病毒 | H3N2 3C.2a | H3N2 3C | 全球 / 2014年 | 超过500000条 | |
| 流感病毒 H1N1 pdm09 | 流感病毒 | H1N1 pdm09 | 经典猪H1N1 / 欧亚禽样猪H1N1 | 墨西哥/美国 / 2009年3月 | 超过250000条 | |
| 埃博拉病毒 Makona | 埃博拉病毒 | Makona | 扎伊尔埃博拉病毒（EBOV） | 几内亚 / 2014年3月 | 约2000条 | |
| 登革病毒 DENV-2 Cosmopolitan | 登革病毒 | DENV-2 Cosmopolitan | DENV-2 | 东南亚/印度洋 / 1974年 | 约8000条 | |
| 猴痘病毒 分支IIb | 猴痘病毒（MPXV） | IIb | 猴痘病毒分支IIa（Clade IIa） | 英国 / 2022年5月 | 超过10万条 | |
| 流感病毒 H5N1 2.3.4.4b | 流感病毒 | H5N1 2.3.4.4b | H5N1 2.3.4.4 | 欧洲 / 2021年 | 约15000条 |
