PhyML最大似然建树——aLRT分支支持度快速检验
原理PhyML采用同时优化树拓扑和分支长度的JTT（Jones-Taylor-Thornton）或替代矩阵。独特的NNI+SPR混合搜索策略：先做快速NNI（Nearest Neighbor Interchange）达到局部最优，再做SPR...
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有效再生数
Rt在2003年SARS和2020年COVID-19疫情期间成为各国公共卫生决策的核心实时指标。与R0不同，Rt不是病毒的固有属性，而是病毒、宿主行为、环境干预三者动态博弈的结果。英国在2020年秋季将Rt压制目标设为低于1.0、意大利按大...
FLiRT（KP.2）
KP.2是JN.1的后代，属于FLiRT家族，以R346T+F456L为标志，2024年春在美国成为主导。
FLuQE（KP.3）
KP.3是KP.2的姐妹谱系，在FLiRT基础上增加Q493E突变形成FLuQE组合，2024年夏季超越KP.2。
FLuQE（KP.3.1.1）
KP.3.1.1在KP.3基础上增加了NTD缺失突变，是2024年秋冬季节的主要流行变异株之一。