Fornax(FL.1.5)
一、关键突变
FL.1.5 站在 XBB.1.9.1 的底子上。XBB.1.9.1 和 XBB.1.5 一样带着 S:F486P,帮助刺突蛋白更牢地抓住 ACE2 受体。FL.1.5 在这个基础上加了 S:F456L,FL.1.5.1 再叠一个 S:K478R。下面这张表是这条演化链上最重要的氨基酸替换。
| 基因 | 突变 | 类型 | 功能影响 |
|---|---|---|---|
| S | F456L | 错义突变(RBD) | FL.1.5 的定义突变。实验室数据表明它能逃逸多数针对 XBB.1.5 的中和抗体,是 2023 年夏天多支 XBB 后代趋同获得的同一个位点 |
| S | K478R | 错义突变(RBD,T478K 位点的二次替换) | FL.1.5.1 的定义突变。与 XBB.1.16(Arcturus)系的 478R 趋同,进一步增强中和抗体逃逸 |
| S | F486P | 错义突变(RBD) | 继承自亲本 XBB.1.9.1。增强刺突蛋白与 ACE2 的结合,与传播力提升相关 |
| S | A701V | 错义突变(S2 区) | 继承自 FL.1。位于刺突蛋白 S2 区,变异报告评估为略有增益,机制未明 |
| ORF1a | G993S | 错义突变 | FL.1 的定义突变,作为谱系标记,未见独立功能影响 |
| ORF1b | K2557R | 错义突变 | FL.1.5 的定义突变,位于非结构蛋白,作为谱系标记 |
相对武汉参考株,FL.1.5 和 FL.1.5.1 的 RBD 区域共有 23 个突变位点:XBB 本底 22 个,再加 F456L。K478R、F486P 是已突变位点上的二次替换,不增加新位点数。
二、命名由来
Pango 命名
Pango 规则只允许三层数字后缀,再深就要启用新前缀。XBB.1.9.1 的后代因此换成了别名 FL,FL 就等于 XBB.1.9.1。FL.1.5 的完整写法是 XBB.1.9.1.1.5,FL.1.5.1 是 XBB.1.9.1.1.5.1。之后 FL.1.5.1 又领到新别名 HN,它往下就是 HN.1、HN.2 这一支。
Fornax 这个名字
Fornax 是南天星座天炉座。2023 年 8 月 11 日,进化生物学家 T. Ryan Gregory 按他和同事提出的天文命名方案,把这个绰号给了 FL.1.5.1。这套方案 2023 年 2 月起用,Hyperion(XBB.1.9.1)、Eris(EG.5.1)都是同一批命名的。媒体和公卫通报经常简写为 Fornax(FL.1.5),严格讲 Fornax 指的是 FL.1.5.1。
与亲本谱系的差别
- FL.1(XBB.1.9.1.1):在 XBB.1.9.1 基础上增加 S:A701V、ORF1a:G993S
- FL.1.5(XBB.1.9.1.1.5):在 FL.1 基础上增加 S:F456L、ORF1b:K2557R
- FL.1.5.1(XBB.1.9.1.1.5.1):在 FL.1.5 基础上增加 S:K478R
三、特征解读
核心特征
F456L 是这支谱系的招牌。2023 年夏天,多支 XBB 后代不约而同拿到了 F456L(趋同演化),EG.5 系也是靠它起家。FL.1.5 先拿 F456L,FL.1.5.1 再叠 K478R,凑齐了当年增长最快的组合。同期的 EG.5.1 用的是 Q52H 加 F456L,路线不同,效果相当。
为什么值得关注
- 美国 CDC 数据显示,2023 年 8 月 19 日当周 FL.1.5.1 已占全美病例的 13.3%,排第二
- 多米尼加共和国一度被它拿到优势地位
- F456L 能逃掉多数针对 XBB.1.5 的中和抗体,给秋季加强针的效果打了个问号
与同类谱系的差异
- 对比 EG.5.1:EG.5.1 用 Q52H 配 F456L,拿到了自己的 Nextstrain 分支 23F;FL.1.5.1 用 K478R 配 F456L,留在亲本的 23D 分支里
- 对比 XBB.1.16(Arcturus):都带 478R,但 XBB.1.16 本体没有 F456L
- 对比亲本 XBB.1.9.1:多了 F456L(FL.1.5.1 再多个 K478R),增长明显提速
四、全球分布
下表基于 GISAID 的开放数据子集(cov-spectrum LAPIS,查询日期 2026-08-22)。开放子集偏向欧美测序量大的国家,不代表全部提交量。FL.1.5 家族(FL.1.5*)在开放子集里共 11,987 条,其中 FL.1.5.1 有 9,112 条,FL.1.5 本体 225 条。时间上集中在 2023 年 4 月至 2024 年 4 月。
| 地区 | 序列数 | 占比 | 趋势 |
|---|---|---|---|
| 美国 | 8,033 | 88.2% | 检出集中在 2023 年中到 2024 年初。CDC 估计 2023 年 8 月 19 日当周占比 13.3%,9 月媒体报道的 Nowcast 数据约 14%,10 月起回落 |
| 英国 | 792 | 8.7% | 2023 年夏秋少量流行,年底收尾 |
| 丹麦 | 132 | 1.4% | 零星检出 |
| 瑞士 | 53 | 0.6% | 零星检出 |
| 德国 | 35 | 0.4% | 零星检出 |
| 其他(斯洛伐克、巴林、法国等) | 67 | 0.7% | 散在检出 |
开放数据里看不到的地方不等于没有流行。neherlab 团队的月度变异报告记录,FL.1.5.1 在多米尼加共和国一度成为优势谱系,在美国、加拿大同步爬升。它的亲本 XBB.1.9.1 历史上在印尼、马来西亚最常见。WHO 统计 2023 年 6 月 19 日至 7 月 23 日的提交序列里,FL.1.5.1 占 F456L 携带谱系的 4.41%,FL.1.5 占 1.08%。
五、传播力评估
相对增长优势
neherlab 团队估算,F456L 加 K478R 的组合周增长率约 35%,差不多每周翻倍。这个速度放在 2023 年的 XBB 后代里相当能打。美国 CDC 的 Nowcast 里,FL.1.5.1 几周内就从不起眼的位置冲到 13.3%,媒体当时形容它的份额接近翻倍。
免疫逃逸能力
F456L 是主要逃逸位点。体外实验显示它能让多数针对 XBB.1.5 的中和抗体失效。Favresse 等 2024 年的研究测了 BNT162b2 二价加强针 6 个月后的中和滴度:FL.1.5.1 几何平均滴度 25.2,低于 XBB.1.5(29.5),但高于 JN.1(22.1)。位置很清楚,比当时的主流更滑,还没滑到 JN.1 那个程度。
临床严重性
没有证据表明 FL.1.5 或 FL.1.5.1 比同期其他 Omicron 亚系更重。症状谱、住院信号都和 XBB 家族一致。WHO 没有对它单独做风险评估,它所属的 XBB.1.9.1 一直挂在 VUM(需监测变异株)名单里。
2023 年 10 月以后,HV.1、JN.1 先后接棒,FL.1.5.1 的份额一路走低。公开数据里它最后的序列停在 2024 年 4 月。就这样。
参考文献
- Parums DV. Editorial: A Rapid Global Increase in COVID-19 is Due to the Emergence of the EG.5 (Eris) Subvariant of Omicron SARS-CoV-2. Med Sci Monit. 2023;29:e942244. DOI: 10.12659/MSM.942244
- Favresse J, Gillot C, Cabo J, et al. Neutralizing antibody response to XBB.1.5, BA.2.86, FL.1.5.1, and JN.1 six months after the BNT162b2 bivalent booster. Int J Infect Dis. 2024;143:107028. DOI: 10.1016/j.ijid.2024.107028
- Tamura T, Ito J, Uriu K, et al. Virological characteristics of the SARS-CoV-2 XBB variant derived from recombination of two Omicron subvariants. Nat Commun. 2023;14(1):2800. DOI: 10.1038/s41467-023-38435-3
- Wang Q, Iketani S, Li Z, et al. Alarming antibody evasion properties of rising SARS-CoV-2 BQ and XBB subvariants. Cell. 2023;186(2):279-286.e8. DOI: 10.1016/j.cell.2022.12.018
