BF.7
关键突变
| 基因 | 突变 | 类型 | 功能影响 |
|---|---|---|---|
| S | R346T | 错义突变 | BF.7的标志性突变,位于RBD区域,是已知的强免疫逃逸位点之一。该突变显著降低中和抗体(包括Evusheld中的Cilgavimab组分)对病毒的识别能力,是BF.7区别于亲本BA.5.2.1的核心变异 |
| S | 69-70del | 缺失 | N末端结构域(NTD)的缺失突变,导致S基因靶标失败(SGTF),可用于PCR初步筛查。增强病毒的传播适应性,在Alpha和BA.1中也曾出现 |
| S | L452R | 错义突变 | RBD关键位点,最早在Delta中出现。增强与ACE2受体的结合亲和力,同时有助于逃避HLA-A24限制性T细胞免疫应答 |
| S | F486V | 错义突变 | RBD区域的免疫逃逸突变,可帮助病毒逃避针对该表位的多类中和抗体,是BA.5谱系的核心免疫逃逸突变之一 |
| S | R493Q | 回复突变 | BA.4/BA.5谱系特征性回复突变(恢复至野生型序列),该位点在BA.1/BA.2中为R493Q突变,BA.4/BA.5回复后增强了受体结合域的稳定性 |
| N | S33F | 错义突变 | 核衣壳蛋白N端区域突变,可能影响病毒核衣壳组装及基因组包装效率 |
| ORF7a | H47Y | 错义突变 | 中国BF.7.14分支的特征性突变,研究发现该突变削弱了ORF7a蛋白的I型干扰素拮抗功能和MHC-I下调能力,可能影响病毒致病性 |
命名由来
BF.7属于Pango动态命名体系下的Omicron(B.1.1.529)谱系分支。Pango命名采用层级式字母数字系统,BA.5谱系下的子分支依次编号。BF.7的完整进化路径为:B.1.1.529(Omicron)→ BA.5 → BA.5.2 → BA.5.2.1 → BF.7。简单说,BF.7就是从BA.5.2.1衍生出来的第7个被正式命名的子分支。
BF.7与亲本BA.5.2.1的关键区别在于刺突蛋白RBD区域额外获得了R346T突变以及N蛋白的S33F突变。BA.5本身已经携带了大量免疫逃逸突变(如L452R、F486V等),而BF.7在此基础上又加上了R346T这个强免疫逃逸位点,相当于在已经很难对付的BA.5身上又披了一层"隐身衣"。
值得一提的是,2022年底中国流行的BF.7在传播过程中还形成了一支独立进化分支,额外获得了ORF7a:H47Y、NSP2:V94L和Spike:C1243F等特征突变,被PANGO正式命名为BF.7.14。这支中国特有分支很可能是在2022年9月底前后从俄罗斯传入内蒙古,之后向北京及周边省份扩散。
特征解读
核心特征:BF.7本质上是一个"BA.5加强版",它的刺突蛋白在继承了BA.5全部17个RBD突变位点的基础上,通过R346T这个"神来之笔"获得了追加的免疫逃逸Buff。R346位点被学界公认是Omicron谱系中最重要的免疫逃逸热点之一,多个成功的变异株(如BQ.1.1、XBB等)都曾独立获得该位点的突变,说明这是病毒在面对人群免疫压力时的"众望所归"之选。
为什么值得关注:BF.7之所以在全球引发警惕,主要有三个原因。第一,它展示出了相当可观的基本再生数(R0),在呼和浩特的临床研究中估算高达13.79(95%CI: 12.44-15.24),这个数字比很多早期Omicron分支都要高。第二,它对Evusheld(tixagevimab/cilgavimab)等预防性单克隆抗体表现出极强的耐药性:加拿大卫生部数据显示BF.7对Evusheld的敏感性降低超过5000倍,基本等于宣告该药物对BF.7无效。第三,2022年底中国调整防控政策后,BF.7在北方地区以惊人的速度传播,成为那波疫情的主要推手之一。
与同类谱系差异:与同期竞争的其他Omicron分支相比,BF.7的"武器库"其实相对精简。BQ.1和BQ.1.1在BF.7的R346T基础上又叠加了K444T和N460K等额外RBD突变,免疫逃逸更加全面;XBB则走的是重组路线,把两个BA.2分支的优势突变整合在了一起。这也是为什么BF.7虽然在2022年底在中国大放异彩(很大程度上是由于中国人群既往感染背景和免疫屏障的特殊性),但在全球范围内最终还是被BQ.1.1和XBB.1.5等更具竞争优势的谱系所超越。
全球分布
| 地区 | 序列数(约) | 占比趋势 | 流行阶段 |
|---|---|---|---|
| 中国大陆 | >15,000 | 2022年10-12月北方地区占比超70%,全国约45% | 2022年底达峰值后快速下降,2023年Q1后基本退出 |
| 比利时 | >1,700 | 早期主要流行国,2022年中后期占BA.5分支的显著比例 | 2022年Q3达峰后下降 |
| 英国 | >660 | 2022年秋季曾被视为最具威胁的三个变异株之一 | 2022年Q4被BQ.1和XBB分支超越 |
| 德国 | >500 | 持续中等水平流行,衍生出多个子分支 | 2022年H2持续存在 |
| 丹麦 | >400 | 2022年H2持续检出 | 2022年Q3-Q4 |
| 美国 | 检出持续 | 占比始终较低,未成为主要流行株 | 2022年H2零星检出 |
| 印度/巴西 | 有检出报告 | 未形成大规模社区传播 | 2022年底零星报告 |
| 全球总计 | >30,000 | 2022年Q3开始全球扩散,2022年底中国疫情推动序列数大增 | 2023年Q1后逐渐被XBB系列取代 |
注:以上序列数为基于GISAID公开数据和文献报道的近似估算值。由于各国测序策略和上报率差异较大,实际感染规模远超序列数。
传播力评估
相对增长优势:BF.7在BA.5基础上的相对增长优势,早期的CovSpectrum估算显示其在欧洲相对于BA.5的周增长率优势约46%(CI: 22%-69%),在比利时约39%(CI: 11%-67%)。这个增长优势在当时的Omicron子分支中属于中上水平,但与同期出现的BQ.1.1(叠加了N460K和K444T)相比还是逊色一些。Gao等人在呼和浩特的421例BF.7感染者研究中估算的R0为13.79,这一数字甚至高于部分早期Omicron谱系的估计值,说明BF.7在易感人群中的传播效率确实不容小觑。
免疫逃逸能力:BF.7的免疫逃逸主要依赖R346T这个关键位点。Qu等人发表在Cell Host & Microbe上的研究清楚表明,BF.7对3剂mRNA疫苗接种者血清、BA.1突破感染者血清和BA.5突破感染者血清的中和抗体滴度均显著低于原始株D614G,虽然其逃逸幅度不如同时携带N460K的BQ.1/BQ.1.1那么夸张。更值得注意的是,加拿大卫生部2023年1月更新数据显示BF.7对Evusheld的敏感性降低超过5000倍,这意味着依赖该药物进行COVID-19暴露前预防的免疫功能低下人群在面对BF.7时几乎等于"裸奔"。国内一项针对Evusheld受者的研究也证实,BF.7相比BA.5对Evusheld的中和活性大幅下降。
临床严重性:从现有数据看,BF.7并未表现出比其他Omicron谱系更高的致病性。呼和浩特的421例临床研究显示:无症状者12.35%,轻型82.42%,普通型4.75%,重型仅0.24%,危重型0.24%。主要症状为发热(约41%)、咳嗽(约41%)和咽干咽痛(约31%),与典型Omicron感染表现一致。值得注意的是,完成3剂疫苗接种的人群中无一例发展到重型/危重型,且3剂接种组的发热率(31.22%)显著低于2剂组(51.37%),提示加强针虽然防感染效果有限,但在减轻症状方面仍有实打实的收益。Scarpa等人的基因组调查也发现BF.7的进化速率相对较低(5.62×10⁻⁴ substitutions/site/year),推测其扩张更多地依赖遗传漂变而非获得决定性适应优势,这或许也解释了它最终被更"凶猛"的XBB和BQ.1系列取代的命运。
参考文献
- Qu P, Evans JP, Faraone JN, et al. Enhanced neutralization resistance of SARS-CoV-2 Omicron subvariants BQ.1, BQ.1.1, BA.4.6, BF.7, and BA.2.75.2. Cell Host Microbe. 2023;31(1):9-17.e3. DOI: 10.1016/j.chom.2022.11.012
- Sun Y, Wang M, Lin W, et al. Evolutionary analysis of Omicron variant BF.7 and BA.5.2 pandemic in China. J Biosaf Biosecur. 2023;5(1):14-20. DOI: 10.1016/j.jobb.2023.01.002
- Gao X, Wang F, Liu H, et al. BF.7: A new Omicron subvariant characterized by rapid transmission. Clin Microbiol Infect. 2023;29(12):1546-1552. DOI: 10.1016/j.cmi.2023.09.018
- Scarpa F, Giovanetti M, Azzena I, et al. Genome-based survey of the SARS-CoV-2 BF.7 variant from Asia. J Med Virol. 2023;95(4):e28714. DOI: 10.1002/jmv.28714
- Akif A, Bhuiyan MA, Islam MR. SARS-CoV-2 Omicron subvariant BF.7 is again triggering the Covid fear: What we need to know and what we should do? J Med Virol. 2023;95(2):e28551. DOI: 10.1002/jmv.28551
