Epsilon（B.1.427 / B.1.429）
1、关键突变Epsilon 谱系（含 B.1.427 与 B.1.429 两条分支）共享 6 个定义性氨基酸突变，分布于 ORF1a、ORF1b 和刺突蛋白（S）三个区域。其中 L452R 位于 RBD 内部，是整个谱系最具功能决定性的位点...
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抗原原罪
抗原原罪说的是一个反直觉的免疫现象：当一个人先后接触过两种抗原性相近但又不完全相同的病毒毒株时，他的免疫系统倾向于优先复用第一次感染或接种时建立的抗体和记忆细胞：哪怕这些"旧工具"对付新毒株的效率已经打了折扣。这个词是1...
重组
重组是指两个或多个亲本病毒在共同感染同一宿主细胞时，其基因组发生断裂和重新连接，产生携带双亲遗传物质子代的过程。与点突变逐个改变核苷酸不同，重组可以在一次事件中引入大片段遗传变异，是病毒进化的重要驱动力。重组在RNA病毒中尤为常见。冠状病毒...
病毒溢出
病毒溢出是指病毒从自然宿主跨越物种屏障感染新宿主的跨物种传播事件。溢出的核心条件是病毒获得在新宿主细胞中复制的能力，通常需要受体结合蛋白发生关键突变以适应新宿主的细胞受体。经典溢出事件包括：HIV-1从黑猩猩溢出至人类（1920年代刚果）、...
HIV-1 溯源：从刚果到全球
案例背景1981年6月，美国CDC报告洛杉矶5名男同性恋者出现卡氏肺孢子虫肺炎——这是AIDS流行病的首次临床识别。截至2024年，全球累计约8800万HIV感染者，约4200万AIDS相关死亡。病原HIV是一种逆转录病毒，分为HIV-1和...
SIR模型
1927年Kermack与McKendrick在《Proceedings of the Royal Society》上发表"A Contribution to the Mathematical Theory of Epidemics"，不仅...
序列间隔
SARS-CoV-2原始株的序列间隔中位数约5-7天，而Delta和Omicron变异株缩短至约2-3天——这一变化直接导致2021-2022年全球多地出现"取代性暴发"。Wallinga与Teunis在2005年建立了基于序列间隔分布的R...