最近共同祖先
Most recent common ancestor
定义：最近共同祖先（MRCA）指一组基因序列、个体或物种在系统发育树中向上追溯时最先交汇于同一节点的祖先。对基因序列而言，MRCA 是现存变异共同来源的节点，它距现在的时间称为 tMRCA（time to most recent common ancestor），通常用分子钟方法估计。MRCA 是相对概念，样本集合不同，对应的 MRCA 也不同，且这个节点不一定是物种起源的祖先。流行病学溯源中，MRCA 常用于限定病原体共同来源的时间范围。
最近共同祖先
概念与提出
最近共同祖先（MRCA）指一组序列或个体沿谱系向上追溯时首次汇合的祖先个体。1982 年 Kingman 提出溯祖理论，为反推共同祖先时间提供框架；Rohde 等（2004）估算，全体现生人类的最近共同祖先距今仅数千年。
应用与意义
线粒体夏娃与 Y 染色体亚当即两条单亲遗传路径上的 MRCA。两者距今约 15 至 30 万年。溯源中 tMRCA 是分子钟定年与系统发育树推断的核心输出；SARS-CoV-2 的 tMRCA 约在 2019 年 11 月前后。它为传播链重建提供了时间锚点。