祖先序列重建
Ancestral Sequence Reconstruction
定义：
祖先序列重建（Ancestral Sequence Reconstruction，ASR）是借现存同源序列与系统发育关系，推断进化树内部节点上祖先核酸或蛋白质序列的计算方法。常用实现有最大简约、最大似然与贝叶斯法。重建结果用于追溯病毒重组与起源历史，也用于合成远古蛋白，检验功能演化假说。概念由Pauling与Zuckerkandl在1963年提出，是分子系统学的基础技术。
祖先序列重建
祖先序列重建（ASR）是反推共同祖先序列的计算方法。它借同源序列与系统发育关系推断进化树内部节点。
方法沿革
鲍林与祖克坎德尔在1963年提出这个概念。菲奇在1971年给出首个简约算法，杨子恒等在1995年建立最大似然框架，成为主流实现。
应用与意义
桑顿等在2003年复活数亿年前祖先类固醇受体。博尼等在2020年重建沙贝病毒进化树，估计SARS-CoV-2与蝙蝠近亲分化于1948至1982年间。钱伯斯等在2026年重建刺突S1/S2祖先序列，说明12碱基插入打断了密码子。