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溯源案例研究

经典溯源案例完整复盘 — 每个案例含图文卡片、时间轴、证据链

亨德拉病毒（HeV）

亨德拉病毒（HeV）1994流行病学调查、病毒分离、血清学筛查、果蝠种群监测

亨德拉病毒溯源：1994年澳大利亚

案例背景1994年9月，澳大利亚昆士兰州布里斯班郊区亨德拉（Hendra）镇，一名驯马师和他的14匹赛马在两周内相继出现急性呼吸道症状并死亡。驯马师本人在接触病马口鼻分泌物后发病，虽幸存但留下永久性脑损伤。病原从病马肺组织中分离确认为一种新型副黏病毒——命名为亨德拉病毒。溯源核心难题：马既不携带类似...

序列数: <50>100条（果蝠）报告: 1994年9月–1995年1月

甲型H5N1禽流感病毒（A/H5N1）

甲型H5N1禽流感病毒（A/H5N1）1997流行病学调查、全基因组系统发育分析、活禽市场监测、血清学调查

H5N1 禽流感溯源：1997年香港

案例背景1997年5月，香港一名3岁男童因流感样症状入院，5天后死于急性呼吸窘迫综合征、Reye综合征和多器官衰竭。常规流感检测无法定型，荷兰伊拉斯谟医学中心和美国CDC先后确认分离株为甲型H5N1禽流感病毒——这是人类历史上首次记录到纯禽源流感病毒直接感染并致死人类。11-12月香港又出现17例确...

序列数: 约50条（1997香港）；全球累计>1000条（H5N1）报告: 1997年5月–1997年12月

尼帕病毒（NiV）

尼帕病毒（NiV）1998-1999流行病学调查、血清学筛查、病毒分离、果蝠生态学调查

尼帕病毒马来西亚疫情溯源

案例背景1998年9月，马来西亚霹雳州和森美兰州的养猪场工人开始出现发热、头痛、意识障碍等脑炎症状。疫情至1999年5月被扑灭，累计报告265例人感染，105例死亡（CFR ~40%）。为阻断疫情，马来西亚政府下令扑杀超过100万头猪——占全国生猪存栏的近一半。病原最终确认为一种新型副黏病毒，以首次...

序列数: 约100条（人类）；约50条（猪）；>30条（果蝠）报告: 1998年9月–1999年5月

马尔堡病毒（MARV）

马尔堡病毒（MARV）1967流行病学调查、病毒分离、绿猴溯源追踪、血清学回溯

马尔堡病毒溯源：1967年实验室疫情

案例背景1967年8月，德国马尔堡和法兰克福以及南斯拉夫贝尔格莱德三地的实验室工作人员同时出现不明原因高热、出血和休克。共32人感染，7人死亡（CFR 22%）。所有感染者均曾接触从乌干达进口用于脊髓灰质炎疫苗生产的非洲绿猴（Chlorocebus aethiops）或猴肾细胞培养物。这是人类历史上...

序列数: 约50条（1967年）；后续非洲暴发累计>200条报告: 1967年8月–1967年9月

中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）

中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）2012-至今流行病学调查、血清学回溯、系统发育分析、病毒分离

MERS-CoV 中东溯源

案例背景2012年4月，约旦扎尔卡一家医院报告了不明原因肺炎聚集性病例（后经回顾确认）。2012年6月，沙特阿拉伯吉达一名60岁男性死于严重肺炎和肾衰竭，荷兰伊拉斯谟医学中心从其痰液中分离出一种新型冠状病毒，命名为MERS-CoV。截至2024年，全球27个国家累计报告约2600例确诊病例，死亡率高...

序列数: >500条（人类）；>300条（单峰骆驼）报告: 2012年4月–至今（散发持续）

甲型H1N1流感病毒（A/H1N1 pdm09）

甲型H1N1流感病毒（A/H1N1 pdm09）2009流行病学调查、全基因组系统发育分析、猪群回顾性血清学调查

2009年 H1N1 猪流感大流行溯源

案例背景2009年3-4月，墨西哥韦拉克鲁斯州和墨西哥城相继出现异常增多的流感样病例和重症肺炎，其中部分年轻健康成人迅速进展至ARDS。4月15日和17日，美国CDC分别从加州两名儿童呼吸道样本中确认一种新型H1N1流感病毒。WHO于6月11日宣布流感大流行——这是41年来首次。疫情至2010年8月...

序列数: >10000条（人类）；>1000条（猪流感病毒参考株）报告: 2009年3月–2010年8月

寨卡病毒（ZIKV）

寨卡病毒（ZIKV）2015-2016流行病学调查、系统发育分析、血清学回溯、蚊媒监测

寨卡病毒巴西疫情溯源

案例背景2015年3月，巴西东北部巴伊亚州和北里奥格兰德州开始出现不明原因的皮疹和发热综合征暴发。同年10月，巴西卫生部注意到新生儿小头畸形病例数异常飙升——较往年基线增加超过20倍。2016年2月WHO宣布寨卡相关小头畸形为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC）。至2016年底，美洲48个国家和...

序列数: >600条（人类）；>50条（蚊媒）报告: 2015年3月–2016年11月（WHO解除PHEIC）

埃博拉病毒（EBOV, 扎伊尔型）

埃博拉病毒（EBOV, 扎伊尔型）2013-2016流行病学调查、系统发育分析、血清学回溯调查

2014年西非埃博拉疫情溯源

案例背景2013年12月，几内亚东南部梅利扬杜（Méliandou）村一名2岁男童出现发热、呕吐和黑便症状，4天后死亡，成为西非埃博拉疫情的首例指示病例。此后病毒在几内亚、塞拉利昂和利比里亚三国持续扩散，至2016年3月WHO宣布疫情结束，累计报告28646例确诊和疑似病例，11323例死亡（CFR...

序列数: 约1610条报告: 2013年12月–2016年3月

SARS冠状病毒（SARS-CoV）

SARS冠状病毒（SARS-CoV）2002-2003流行病学调查、血清学筛查、系统发育分析、病毒分离培养

SARS-CoV 溯源：2002-2003年广东疫情

案例背景2002年11月，广东佛山出现首例非典型肺炎病例，随后疫情经香港扩散至全球29个国家和地区，累计8096例确诊，774例死亡（CFR ~9.6%）。2003年4月WHO实验室网络确认病原为一种新型冠状病毒——SARS-CoV。溯源核心难题：病原确认后，病毒的自然宿主是谁？果子狸是直接来源还是...

序列数: 约140条（人类）；>100株（蝙蝠）报告: 2002年11月–2003年7月

人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）

人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）1920年代–1981年系统发育分析、分子钟推算、溯祖理论、档案血清学回溯

HIV-1 溯源：从刚果到全球

案例背景1981年6月，美国CDC报告洛杉矶5名男同性恋者出现卡氏肺孢子虫肺炎——这是AIDS流行病的首次临床识别。截至2024年，全球累计约8800万HIV感染者，约4200万AIDS相关死亡。病原HIV是一种逆转录病毒，分为HIV-1和HIV-2两型，全球大流行的主要驱动者为HIV-1 M组。溯...

序列数: 数千条（HIV-1 M组）；数百条（SIVcpz）报告: 约1920年–1981年（首次临床识别）