案例背景

2016年10月,中国广东省清远市一家大型养猪场暴发新生仔猪急性严重腹泻——出生2-6天的仔猪在数小时内出现剧烈水样腹泻和呕吐,病死率接近100%。最初怀疑为流行性腹泻病毒(PEDV)或猪德尔塔冠状病毒(PDCoV),但常规RT-PCR均为阴性。华南农业大学和农科院联合团队通过宏基因组测序发现病原为一种全新的α冠状病毒——与蝙蝠HKU2冠状病毒高度同源(约95%全基因组一致)。

溯源核心难题:这次暴发发生在SARS的同一地理区域(广东),同一自然宿主(菊头蝠),甚至同一研究团队(石正丽团队)参与了SARS溯源和SADS溯源——这暗示了什么?

溯源过程

时间事件方法结论
2016.10-2017.01广东清远猪场仔猪高致死率腹泻排除PEDV/TGEV/PDCoV已知猪肠道冠状病毒全部阴性
2017.01-03宏基因组测序发现新型α冠状病毒宏基因组测序、RT-PCRSADS-CoV与蝙蝠HKU2冠状病毒全基因组约95%一致性
2017-2018石正丽团队对猪场周边蝙蝠粪便进行系统性采样蝙蝠粪便宏基因组猪场附近菊头蝠粪便中检出HKU2相关冠状病毒——RdRp基因与SADS-CoV同一性>98%
2017.05猪场病毒自行消散SADS-CoV在猪群中未能建立持续循环——可能与猪群感染后迅速获得群体免疫有关

关键证据链

  • 空间聚焦:暴发猪场位于广东清远——与2002年SARS首例人类病例的所在的同一省份,且猪场附近有大量菊头蝠(Rhinolophus spp.)栖息。
  • 时间聚焦:2016年10月猪场暴发→2017年1月确诊→2017年5月自行消散——从暴发到消散约7个月。
  • 宿主关联:蝙蝠自然宿主依然是菊头蝠(SARS-CoV也来自同一属)。值得注意的是SADS-CoV在猪中造成100%仔猪致死率——但在蝙蝠中完全无症状。这与SARS-CoV在果子狸/人类中致死而在蝙蝠中无症状的模式完全相同。
  • 分子聚焦:SADS-CoV使用与SARS-CoV不同的受体——不是ACE2,而是猪的APN(氨肽酶N)。这提示SADS-CoV不是"第二颗SARS炸弹"——它不太可能直接使用人ACE2感染人类。但APN在人类中也表达,且其他α冠状病毒(如HCoV-229E)已能使用人APN。

方法论价值

SADS溯源是"同一个自然宿主、同一个地理区、同一个研究团队、同样的病原"重复三次——SARS(2002)、MERS(2012)和SADS(2016)——的"不幸预言"。石正丽团队在Nature的SADS报告(2018)中明确提出:华南地区的菊头蝠冠状病毒库是全球新发传染病的"定时弹药库",SADS只是其中一枚"哑弹"(未实现人类感染)。该文敦促在活猪养殖场和人类的哨点监测中纳入广谱冠状病毒筛查。

FAQ

Q:SADS和SARS有关系吗?

A:有天然的联系——同一个地理区域(广东)、同一属自然宿主(菊头蝠)、同一病毒家族(冠状病毒科)、甚至核心研究团队重叠。但病毒本身分属不同属:SARS-CoV是β冠状病毒,SADS-CoV是α冠状病毒——两者受体和使用策略不同。

Q:SADS病毒能感染人吗?

A:目前无人类感染报告——现场养猪场工人的血清学调查未检出SADS-CoV抗体。但SADS-CoV使用猪APN受体,人APN与猪APN氨基酸序列约78%一致——体外感染实验不完全排除。更关键的是:SADS-CoV证明菊头蝠冠状病毒可"随时随地"溢出到家畜——下一次溢出的可能是能感染人的毒株。

Q:SADS-CoV后来去哪了?

A:2016-2017年暴发后SADS-CoV在广东猪场中"消失"了。但Zhou等(2019)的回顾调查发现,2017年暴发前后广东其他猪场也有散发的SADS-CoV阳性样本——提示低水平循环可能存在。持续监测是防止"下一次SARS从猪场开始"的必要投入。

参考文献

  1. Zhou P, Fan H, Lan T, et al. Fatal swine acute diarrhoea syndrome caused by an HKU2-related coronavirus of bat origin. Nature. 2018;556(7700):255-258. DOI: 10.1038/s41586-018-0010-9
  2. Gong L, Li J, Zhou Q, et al. A New Bat-HKU2–like Coronavirus in Swine, China, 2017. Emerg Infect Dis. 2017;23(9):1607-1609. DOI: 10.3201/eid2309.170915
  3. Zhou L, Sun Y, Lan T, et al. Retrospective detection and phylogenetic analysis of swine acute diarrhoea syndrome coronavirus in pigs in southern China. Transbound Emerg Dis. 2019;66(2):687-695. DOI: 10.1111/tbed.13008

引用本案例

基因溯源数据中心. “SADS-CoV 猪急性腹泻综合征冠状病毒溯源” 溯源案例研究. http://www.jiyinsuyuan.cn/index.php?c=show&id=189