XBB.1.9.1
XBB.1.9.1 是 SARS-CoV-2 Omicron XBB 的亚系,以 Spike F486P 突变为定义特征。2023 年上半年在全球传播,其后代 EG.5(Eris)在夏季成为多地主导谱系。WHO 将 EG.5 列为 VOI。XBB.1.9.1 的免疫逃逸能力显著强于 XBB.1.5。
关键突变
XBB.1.9.1 的核心特征是 Spike 蛋白 F486P 突变。F486 位于 RBD 的受体结合基序(RBM)中心,是中和抗体的主要靶点之一。F486P 突变使病毒能够逃逸 RBD class 1 和 class 2 中和抗体,同时通过 R493Q 突变恢复与 ACE2 受体的结合能力。这种"逃逸-恢复"协同机制是 XBB 谱系进化的典型特征。
| 基因 | 突变 | 类型 | 功能影响 |
|---|---|---|---|
| Spike | F486P | 错义 | XBB.1.9.1定义突变,显著增强免疫逃逸 |
| Spike | R493Q | 错义 | RBD,恢复ACE2结合能力(与F486P协同) |
| Spike | F490S | 错义 | RBD,逃逸部分中和抗体 |
| Spike | G339H | 错义 | NTD,影响抗原超位点 |
| Spike | S371L | 错义 | RBD,影响抗体识别 |
| Spike | S373P | 错义 | RBD,影响抗体识别 |
| Spike | S375F | 错义 | RBD,影响抗体识别 |
| Spike | N460K | 错义 | RBD,影响部分中和抗体结合 |
命名由来
XBB.1.9.1 是 Omicron BA.2.10.1 的重组后代,由 BJ.1 和 BM.1.1.1 重组产生。Pango 命名中"X"表示重组谱系,"BB"表示第 28 个被指定的重组谱系,".1.9.1"表示其亚系层级。XBB.1.9.1 的后代 EG.5 获得了 WHO 希腊字母命名(Eris),但 XBB.1.9.1 本身未获得希腊字母命名。
特征解读
F486P 突变在 XBB 谱系中首次出现,标志着 XBB 进化进入新阶段。与 XBB.1.5 相比,XBB.1.9.1 的免疫逃逸能力显著增强,对 XBB.1.5 疫苗突破感染血清的中和抗体滴度下降约 3-4 倍。F486P 与 R493Q 的协同作用使病毒在增强免疫逃逸的同时维持受体结合能力,这种进化策略在 SARS-CoV-2 中反复出现。2023 年夏季,XBB.1.9.1 的后代 EG.5 在全球快速传播,成为多个地区的主导谱系。
全球分布
XBB.1.9.1 于 2023 年上半年在全球多地被检出,其后代 EG.5 在夏季成为主导谱系:
| 地区 | XBB.1.9.1/EG.5 占比 | 峰值时间 | 趋势 |
|---|---|---|---|
| 美国 | 约 20-25% | 2023年8月 | 后被 BA.2.86/JN.1 取代 |
| 加拿大 | 约 15-20% | 2023年8月 | 后被 BA.2.86/JN.1 取代 |
| 中国 | 约 10-15% | 2023年7月 | 后被 BA.2.86/JN.1 取代 |
| 英国 | 约 15-20% | 2023年9月 | 后被 BA.2.86/JN.1 取代 |
XBB.1.9.1 及其后代 EG.5 在 2023 年夏季达到流行高峰后,秋季起占比逐步被 BA.2.86 及其后代 JN.1 取代。
传播力评估
XBB.1.9.1 的有效再生数(Re)高于 XBB.1.5 约 1.2-1.5 倍,F486P 突变被认为增强了病毒在已感染人群中的传播适应性。免疫逃逸方面,XBB.1.9.1 对 XBB.1.5 疫苗突破感染血清的中和抗体滴度较 XBB.1.5 下降约 3-4 倍,显著高于 XBB.1.5 的免疫逃逸水平。临床严重性方面,暂无证据表明 XBB.1.9.1 导致比 XBB.1.5 更严重的疾病。WHO 将 XBB.1.9.1 列为监测中的变异株(VUM),其后代 EG.5 于 2023 年 9 月升级为关注变异株(VOI)。
参考文献
- WHO. Updated Risk Evaluation for EG.5 and its sublineages. 2023. WHO EG.5 Risk Assessment
- Uraki R, et al. Distinct evolution of SARS-CoV-2 Omicron XBB and BA.2.86/JN.1 lineages combining increased fitness and antibody evasion. Nat Commun. 2024;15:8556. DOI: 10.1038/s41467-024-46490-7
- CDC. Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants. MMWR. 2024;73(42). DOI: 10.15585/mmwr.mm7342a1
