肠道病毒D68型 Clade B1
发现：从偶发病例到全国暴发肠道病毒D68型（EV-D68）1962年首次在加州被分离出来。当时从4名患肺炎和支气管炎的儿童咽拭子中获得了这个病毒。在之后四十多年里，它几乎处于"休眠"状态。1970年到2005年间，全美仅记录了26例确诊病例...
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Nextclade——病毒基因组突变谱与谱系一键分型
原理拿到一条病毒基因组序列，第一个问题往往是：它属于哪个谱系、带了哪些突变？Nextclade 就是干这个的。它把_query_序列跟参考基因组做比对，逐个位置找出核苷酸和氨基酸层面的差异，再根据这些突变给出 Pango 谱系分类。跟 Pa...
猴痘病毒 Clade IIa
关键突变以下为猴痘病毒 Clade IIa 相对于 Clade I 的主要基因组突变：基因突变类型功能影响OPG043A226T错义包膜蛋白，可能影响病毒粒子形态OPG044多个SNP错义免疫调节蛋白，影响宿主免疫逃逸OPG103多个缺失缺...
猴痘病毒 Clade Ia
猴痘病毒 Clade I
猴痘病毒 分支IIb
猴痘病毒分支IIb是2022年全球猴痘疫情的主要驱动谱系，属于西非分支（Clade II），以APOBEC3驱动的持续微演化和人传人传播链为特征。