宏基因组组装——无偏倚病原体基因组重建
原理宏基因组组装是从复杂环境样本（如水体、土壤、临床标本）的混合测序数据中重建完整或近完整基因组序列的计算方法。核心逻辑是利用序列重叠（overlap）将短读长拼接为长片段（contig），再通过配对末端信息或长读长数据将 contig 连...
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宏基因组鸟枪法测序——无偏倚病原体筛查策略
原理宏基因组鸟枪法（mNGS）从临床样本中直接提取总核酸，构建测序文库后高通量测序，将产生的reads与参考数据库比对进行物种分类注释。与传统靶向PCR相比，mNGS无需预先知道目标病原体，理论上可覆盖所有病毒、细菌、真菌和寄生虫的核酸。检...