原理
硅胶膜离心柱提法是Boom等人1990年建立的经典核酸纯化方法。病毒样本经含胍盐的裂解液处理后,核酸在高盐条件下与硅胶膜上的SiO₂基团形成氢键吸附。经两次含乙醇洗涤去除蛋白和盐分后,用低离子强度洗脱液(水或TE)破坏氢键,释放纯化核酸。该方法可从140 μL样本中回收80%以上的病毒RNA。
步骤
1. 裂解
140 μL样本(血清或VTM上清)加入560 μL裂解液AVL(含carrier RNA),涡旋15秒,室温孵育10 min。Carrier RNA作为共沉淀载体,显著提高微量核酸的回收率。
2. 结合
加入560 μL无水乙醇,涡旋15秒。将混合液分两次过柱(630 μL/次),8000 rpm离心1 min,弃滤液。乙醇调节结合条件使核酸更牢固地结合硅胶膜。
3. 洗涤
分别用AW1和AW2洗涤液各500 μL洗柱1次,8000 rpm离心1 min。AW2洗涤后空柱14000 rpm离心3 min,彻底干燥硅胶膜——残余乙醇严重抑制后续RT-PCR。
4. 洗脱
将柱子转移至新收集管,加60 μL洗脱液AVE(或DEPC水)至膜中央,室温静置1 min后8000 rpm离心1 min。洗脱液预热至60℃可提高得率约10%。
关键试剂与条件
| 试剂/耗材 | 规格 | 用量 | 作用 |
|---|---|---|---|
| 裂解液AVL | 含胍盐+carrier RNA | 560 μL/样本 | 裂解+结合条件 |
| QIAamp离心柱 | 硅胶膜,700 μL容积 | 1支/样本 | 核酸结合载体 |
| 洗涤液AW2 | 含乙醇 | 500 μL | 去盐洗脱 |
FAQ
Q:为什么要加carrier RNA?
A:病毒核酸量极低(ng级别),carrier RNA作为惰性填充物占据硅胶膜非特异性结合位点,并将微量核酸"托举"在膜表面。不加carrier RNA会导致回收率下降50-80%。
Q:柱提法和Trizol法怎么选?
A:柱提法适合血清/咽拭子等液体样本,提取的RNA完整性略低于Trizol但纯度更高(260/280≈1.8-2.0)。Trizol适合组织和细胞(含大量蛋白),但操作更繁琐且涉及有机溶剂。病毒溯源常规检测优先柱提法。
Q:离心速度必须严格8000 rpm吗?
A:8000 rpm是推荐值,6000-10000 rpm均可。速度过快(>12000 rpm)可能使硅胶膜变形导致渗漏,速度过慢(<5000>
参考文献
- Boom R, Sol CJ, Salimans MM, et al. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J Clin Microbiol. 1990;28(3):495-503. DOI: 10.1128/jcm.28.3.495-503.1990
- Yang G, Erdman DD, Kodani M, et al. Comparison of commercial systems for extraction of viral RNA. J Virol Methods. 2011;171(1):206-210. DOI: 10.1016/j.jviromet.2010.10.027
