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分类
样本采集
试剂盒
PEG 8000
货号
Sigma-89510
样本类型
城市污水/地表水
预计时间
~4-8 h/批次(含沉淀过夜)
样本采集

环境水样浓缩富集——水体携带病毒的溯源采样方法

方法定义:污水流行病学通过分析市政污水中的病毒核酸,可提前预警社区疫情暴发。PEG沉淀法是经典的水样病毒浓缩方法,加PEG 8000和NaCl沉淀病毒颗粒后高速离心回收。适用于肠道病毒、诺如病毒和SARS-CoV-2的污水监测。

原理

污水流行病学(WBE)通过检测城市污水中的病毒核酸,无需个体采样即可评估社区感染趋势。但病毒在污水中的浓度极低(通常1-10^3 copies/L),必须先行浓缩富集。PEG沉淀法利用聚乙二醇8000的高亲水性,竞争性剥夺病毒颗粒表面的水化层,使病毒与杂质共沉淀,NaCl提供离子强度促进沉淀形成。

步骤

1. 水样采集与预处理

在污水厂进水口用自动采样器收集24 h复合水样,取500 mL。先用0.45 μm滤膜过滤去除细菌和悬浮颗粒,保留滤液——病毒可穿过滤膜。

2. PEG沉淀

向500 mL滤液中加入PEG 8000(终浓度10% w/v)和NaCl(终浓度2.25% w/v),搅拌至完全溶解。4℃静置沉淀过夜(≥12 h),可见白色絮状沉淀。

3. 回收沉淀

10000 g、4℃离心30 min。弃上清,沉淀用5 mL PBS缓冲液重悬——此时体积浓缩100倍。

4. 二次纯化(可选)

若重悬液仍有颗粒物,3000 g离心5 min去杂质。用0.22 μm针式过滤器除菌后直接提取核酸,或-80℃保存浓缩液。

关键试剂与条件

试剂/耗材规格用量作用
PEG 8000Sigma 89510, 平均分子量800050 g/500 mL水样病毒沉淀剂
NaCl分析纯11.25 g/500 mL水样提供离子强度
PBS缓冲液1×, pH 7.4, 无菌5 mL/样本重悬病毒沉淀

FAQ

Q:PEG沉淀和超滤浓缩怎么选?

A:PEG沉淀成本低、通量大,适合大规模污水监测。超滤回收率更高(~80% vs ~50%),但滤膜成本高且易堵。日常监测优先PEG沉淀,精准定量选超滤。

Q:污水中有PCR抑制剂怎么办?

A:腐殖酸、重金属等抑制剂会共沉淀。对策:① 用含PVPP的裂解液捕获腐殖酸;② 选耐受抑制剂的PCR预混液;③ 加MS2噬菌体做内参监控回收率。

Q:采样点选哪里最合适?

A:污水厂进水口代表城市面源,适合大规模监测。社区泵站定位更精准。溯源特定暴发优先选医疗机构的排污口。

参考文献

  1. Ahmed W, Angel N, Edson J, et al. First confirmed detection of SARS-CoV-2 in untreated wastewater in Australia. Sci Total Environ. 2020;728:138764. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2020.138764
  2. Wu F, Zhang J, Xiao A, et al. SARS-CoV-2 Titers in Wastewater Are Higher than Expected from Clinically Confirmed Cases. mSystems. 2020;5(4):e00614-20. DOI: 10.1128/mSystems.00614-20