HyPhy选择压力分析——病毒适应性进化的dN/dS全谱检测流程
原理病毒蛋白编码基因在宿主免疫、抗病毒药物和跨种传播三重压力下发生适应性进化。鉴定哪些氨基酸位点受到了正选择（dN/dS > 1）还是净化选择（dN/dS < 1），是理解病毒溯源中关键分子事件的前提。HyPhy 在一个统一的系统发育框架下...
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趋同进化
不同病毒谱系在相似的选择压力下，独立选中同一个氨基酸位点，发生相同方向的突变：这种现象就叫趋同进化。在SARS-CoV-2流行期间，N501Y突变先后在Alpha、Beta、Gamma和Omicron中独立出现，成了教科书级别的案例。同样的...