Freyja废水变异株解卷积——基于等位基因频率的群体变异监测
原理废水基因组监测的基本思路不复杂:感染者排出含有病毒核酸的粪便和呼吸道分泌物,这些核酸进入下水道后混合在一起,形成一份"全社区"的病毒池。传统的废水测序只能告诉你"这里面有多少SARS-CoV-2 RNA&q...
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原理废水基因组监测的基本思路不复杂:感染者排出含有病毒核酸的粪便和呼吸道分泌物,这些核酸进入下水道后混合在一起,形成一份"全社区"的病毒池。传统的废水测序只能告诉你"这里面有多少SARS-CoV-2 RNA&q...
案例背景2026年5月5日,世界卫生组织接到刚果(金)伊图里省Mongbwalu卫生区一起"不明原因高致死率疾病"的警报。多名患者出现了发热、呕吐、腹泻和出血倾向:症状模式和埃博拉病毒病高度吻合,但该区域此前经历的主要是...
续发率衡量传染病在密切接触者中的传播效率,定义为原发病例引入感染后,在其最长潜伏期内易感接触者中发生继发病例的比例。该指标最早用于家庭内传播研究,后扩展至学校、医院等封闭环境。2003年SARS疫情期间,续发率成为区分超级传播事件与常规传播...
案例背景轮状病毒是全球婴幼儿重症腹泻的首要病原——疫苗前时代每年约52.7万5岁以下儿童死亡(主要集中在南亚和撒哈拉以南非洲)。1973年澳大利亚Ruth Bishop团队通过十二指肠活检的电子显微镜首次识别轮状病毒颗粒。病毒的外壳形似车轮...
R0是传染病动力学模型中最核心的阈值参数之一,也是公共卫生决策中"压平曲线"策略的理论基石。该概念1927年由Kermack与McKendrick在SIR仓室模型中首次形式化定义,至今仍是各国疾控机构评估新发传染病大流行潜力的首选参数。SA...