一、案例背景

1995年1月,扎伊尔(今刚果民主共和国)班顿杜省基奎特市出现埃博拉出血热疫情。基奎特是个人口约40万的城市,位于金沙萨以东约400公里。病原是扎伊尔型埃博拉病毒(Zaire ebolavirus,EBOV),1976年亚姆布库疫情的元凶也是它。疫情前后持续约7个月,最终记录315例病例,254人死亡,病死率81%。其中80例(25%)是医护人员,医院成了疫情的核心放大器。

溯源工作的起点很难。首例患者1月6日发病,7天后就死了。当时没人想到埃博拉,早期病例被当成志贺菌痢疾来治。病毒在家族和病房里悄悄传了近4个月,直到4月中旬一台腹部手术把整条传播链点爆,卫生系统才意识到出了大事。到这时,追溯源头已经只能靠回顾性访谈和医院记录。没别的。

二、溯源过程

时间事件方法结论
1995年1月6日至13日42岁木炭工兼农民发病,7天后死于基奎特总医院回顾性访谈、接触者追踪疫情起点确立,职业指向森林暴露
1995年1月至3月家族成员成批死亡,媒体报道23名家族成员中13人死亡家族谱系调查、葬礼习俗访谈葬礼洗尸等密切接触驱动家庭内传播
1995年4月10日基奎特第二妇产医院化验技师基姆福穆在基奎特总医院接受剖腹手术医院记录审查、临床观察手术暴露引爆医院超级传播链
1995年4月下旬至5月初医护与修女成批发病死亡,血性腹泻病例上报卫生部门主动病例搜索院内暴发被识别,初判为志贺菌痢疾
1995年5月4日至9日14份急性期血样送往美国CDC病毒分离、抗原检测确诊埃博拉,国际响应启动
1995年5月11日起建立隔离病房、实行屏障护理、关闭二级医院感染控制干预医护新发感染骤减,传播链被切断
1995年5月至7月逐户搜索、医院和诊所登记审查、莫桑戈疫点调查病例定义筛查、接触者追踪累计315例,最后1例7月16日死亡
1995年8月24日连续42天无新病例疫情监测WHO宣布疫情结束

三、关键证据链

空间证据

传播链牢牢钉在医疗设施上。首例死在基奎特总医院,这家350床医院随后成为核心疫点。基姆福穆这条线,从基奎特第二妇产医院开始,经手术带进总医院。病毒还沿转院路径外溢:莫桑戈镇的23例病例里,8例是从基奎特总医院转过去的。Roels等人的分析显示,住院和探访发热出血病人都是感染风险因素。这不是社区随机扩散,是医院网络的点对点传播。

时间证据

链条在时间上完全闭合。首例1月6日发病,1月13日死亡。家族死亡集中在1月中旬到3月。医院放大发生在4月。最后1例患者7月16日死亡,8月24日宣布结束。每一环的接触史都与埃博拉潜伏期(2到21天)吻合。Khan等人的报告还指出,两名个体可能是超过50例病例的感染来源,典型的人传人超级传播结构。

宿主证据

这是整条链上最弱的一环。首例患者是农民兼木炭工,住在基奎特,大部分时间在周边森林里劳作。这指向动物源性溢出,但到底是哪种动物,不知道。疫情过后Leirs等人采样了3066只脊椎动物,埃博拉抗体全部阴性,病毒分离也没成功。人传人的证据很强,源头动物那一步始终悬空。

分子证据

疫情当中CDC就完成了GP基因测序。1995年毒株与1976年亚姆布库毒株相比,GP全长核苷酸差异不到1.6%。两次疫情相隔19年、相距上千公里,病毒却几乎没变。Rodriguez等人对9名患者测了GP基因最易变区段,结果零变异。没有共流行的多个变异株,也没有随人传人积累的突变,说明这是一条单一毒株的传播链。恢复期患者精液中病毒RNA最长存在101天,第82天仍分离出活病毒。这批序列现在都在GenBank里,包括两条全基因组(AY354458、KC242796)。

四、方法论价值

这次溯源用的是一套组合拳。回顾性接触者追踪加访谈还原链条,医院记录审查加病例对照分析锁定风险因素,医护血清学调查评估隐性感染(402名无症状医护里只有12例弱阳性),病毒分离和RT-PCR加GP基因测序坐实病原,最后还有宿主动物筛查。这几类方法分别对应本站方法论栏目的《接触者追踪》《病例对照研究》《血清学调查》《病毒基因组测序与系统发育分析》《动物宿主调查》篇。这套组合后来成了埃博拉疫情溯源的标准模板,它也证明了一件事:哪怕自然宿主找不到,靠流行病学加分子证据,照样能把人间传播链钉死。

五、常见问题

  1. 1995年基奎特埃博拉疫情的第一个病人是谁?首例是42岁的农民兼木炭工加斯帕德·门加(Gaspard Menga,媒体报道用名)。他1月6日发病,1月13日在基奎特总医院死亡。他大部分时间在基奎特周边的森林劳作,怎么染上的病毒,至今没人说得清。

  2. 基奎特总医院为什么成了超级传播场所?医院缺手套、缺防护,针头和器械复用很普遍,早期病例又被误诊为志贺菌痢疾。4月10日,感染埃博拉的化验技师基姆福穆在总医院做了剖腹手术,参与手术的两组医护接连死亡。25%的病例是医护人员,总医院医生感染率达31%。

  3. 基奎特疫情的病毒和1976年亚姆布库疫情是同一个病毒吗?同种不同株,都是扎伊尔型埃博拉病毒。GP基因全长测序显示两者核苷酸差异不到1.6%。19年时间、上千公里距离,病毒几乎没变,说明自然界里存在稳定维持病毒的机制。

  4. 基奎特疫情是怎么控制住的?5月9日确诊后,国际团队迅速到位。建立隔离病房、实行屏障护理、关闭二级医院、培训红会人员安全下葬。5月11日之后医护感染基本停止。7月16日最后一例死亡,8月24日疫情宣布结束。

  5. 基奎特疫情找到埃博拉的自然宿主了吗?没有。3066只脊椎动物的抗体检测和病毒分离全部阴性。首例患者的森林劳作史只是间接线索。果蝠假说要到多年以后才慢慢积累起证据。

参考文献

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  8. Sanchez A, Trappier SG, Mahy BW, et al. The virion glycoproteins of Ebola viruses are encoded in two reading frames and are expressed through transcriptional editing. Proc Natl Acad Sci U S A. 1996;93(8):3602-3607. DOI: 10.1073/pnas.93.8.3602

引用本案例

基因溯源数据中心. “1995年刚果(金)基奎特埃博拉疫情溯源:医院超级传播链与指数病例木炭工的流行病学证据链” 溯源案例研究. https://www.jiyinsuyuan.cn/anli/344.html