一、案例背景

2003年5月到6月,美国中西部六个州接连出现发热伴丘疱疹的病人。绝大多数病人都有宠物草原犬鼠(Cynomys属)的接触史。这是猴痘病毒第一次在非洲以外引起社区暴发,也是西半球第一起人猴痘疫情。

截至2003年7月8日,CDC共收到71例报告。威斯康星39例,印第安纳16例,伊利诺伊12例,密苏里2例,堪萨斯1例,俄亥俄1例。35例实验室确诊。18人住院,2名儿童重症,其中1名出现脑炎。所有人都康复了,零死亡。

溯源难题摆得很清楚。病人没去过非洲。草原犬鼠是北美本土动物,野生种群不携带猴痘病毒。病毒从非洲怎么到的北美,草原犬鼠又怎么变成传染源,必须靠宠物贸易的链条才能说通。

二、溯源过程

调查分两条线走。动物线往前查进口记录,病例线往后追动物去向。时间轴如下。

时间事件方法结论
2003年4月9日约800只小型哺乳动物从加纳阿克拉运抵得州进口商TX-1,含762只非洲啮齿类、6个属进口记录核查非洲啮齿类存在进入美国的商业渠道
2003年4月15日至21日冈比亚巨鼠先转手艾奥瓦经销商,4月21日伊利诺伊经销商IL-1购入巨鼠和睡鼠交易单据核查、访谈源头候选动物进入伊利诺伊
2003年4月至5月IL-1设施里约200只草原犬鼠与非洲啮齿类邻近混养现场调查跨物种接触窗口出现
2003年5月13日威斯康星州3岁女孩被自家草原犬鼠咬伤手指。犬鼠当天发病,5月20日死亡临床病史采集索引病例确立
2003年6月2日至4日Marshfield实验室在患儿母亲皮损和犬鼠淋巴结组织里,用电镜看到痘病毒颗粒电子显微镜怀疑方向指向正痘病毒感染
2003年6月6日CDC对患者4、7、8(含一名经销商)的标本PCR检出猴痘DNAPCR病原锁定猴痘病毒
2003年6月7日血凝素基因测序比对,序列与两个参考分支之一完全一致基因测序暴发株归属西非分支
2003年6月11日CDC与FDA发布联合禁令:禁止非洲啮齿类进口,暂停草原犬鼠州际运输销售行政管控贸易链条被切断
2003年6月至7月加纳货批检出阳性动物:1只冈比亚巨鼠、3只睡鼠、2只绳松鼠。IL-1的4只草原犬鼠也阳性PCR、病毒分离、免疫组化感染动物的证据链闭合
2003年7月8日累计71例(35例确诊),末例6月20日发病病例监测、病例定义复核暴发终止,零死亡
2004年至2005年对2003年分离株做全基因组测序,与西非、中非株比较全基因组测序、系统发育分析暴发株属西非分支,毒力低于中非分支

三、关键证据链

空间证据:一条跨大西洋的贸易线

链条是:加纳(阿克拉)到得州,再到艾奥瓦、伊利诺伊,最后流向威斯康星、印第安纳等州的宠物店和跳蚤市场。全部35例确诊人类病例,都能回溯到IL-1售出的草原犬鼠。762只非洲啮齿类里,584只被追踪到6个州的经销商,剩下178只记录不全,追不下去。

时间证据:每个节点都卡得上

4月9日动物入境。4月21日非洲动物到达伊利诺伊。5月11日,一批草原犬鼠在威斯康星沃索的跳蚤市场售出。5月13日咬伤女孩。女孩母亲5月26日发病。全美发病高峰落在5月29日至6月9日。末例6月20日发病。整个时间窗跟草原犬鼠的销售分发节奏对得上。潜伏期中位数12天,也落在合理区间。

宿主证据:巨鼠是源头,草原犬鼠是桥梁

CDC从加纳货批里检出阳性动物:1只冈比亚巨鼠、3只睡鼠、2只绳松鼠。后来对隔离动物的系统评估里,至少33只检出猴痘DNA,22只分离出活病毒。阳性集中在巨鼠、睡鼠、绳松鼠这三种非洲动物身上。草原犬鼠4只阳性。人类病例绝大多数接触过草原犬鼠,没有一例与直接接触非洲啮齿类挂钩。结论很清楚:非洲啮齿类把病毒带进美国,草原犬鼠负责把病毒送到人手上。

弱的一环也在这里。病毒到底从巨鼠还是睡鼠传给草原犬鼠的,没人目击过。靠的是同屋混养这个接触事实做的推断。冈比亚巨鼠是不是猴痘的自然储存宿主,非洲本土的生态学证据也不完整。就这样。

分子证据:同一个分支,同一个来源

人、草原犬鼠、非洲啮齿类身上检出的序列,都属于猴痘病毒西非分支。2003年暴发株的全基因组存在GenBank,登录号DQ011157,株名USA_2003_039,全长198780 bp。它与西非参考株WRAIR7-61(登录号AY603973)高度同源,和中非(刚果盆地)分支分属两个clade。Chen等在2005年做全基因组比较,顺带解释了零死亡。西非分支毒力低于中非分支,差异集中在D14L等少数基因上。分子证据的局限是分辨率。它能证明暴发株来自西非、各分离株几乎一致,支持单次传入。但说不出是巨鼠、睡鼠还是绳松鼠里的哪一只传的。

四、方法论价值

这次溯源用的全是成熟武器,赢在组合。流行病学调查先划出动物贸易网络,把跨洋路径钉死。电镜和免疫组化做形态初筛,几天内把怀疑方向从鼠疫、土拉菌病扭到正痘病毒。PCR加基因测序确认猴痘病毒,同时排除天花病毒和疫苗株。这顺带回应了当时对生物恐怖袭击的担忧。全基因组测序和系统发育分析最后贴上西非分支标签。动物侧的病毒分离和血清学补足了宿主环节。草原犬鼠的病理研究还提示呼吸道、黏膜接触两条传播途径。这套流程对应本中心方法论栏目的《暴发溯源中的流行病学调查》《病原形态学鉴定》《分子检测与基因测序》《系统发育分析》。2003年这个案例,至今还是动物贸易溯源的标准教材。

五、FAQ

  1. 2003年美国猴痘暴发是怎么引起的?宠物贸易。加纳进口的非洲啮齿类在伊利诺伊跟草原犬鼠混养,草原犬鼠感染后被当作宠物卖给多个州的家庭。
  2. 草原犬鼠会传播猴痘病毒吗?会。绝大多数病例都有草原犬鼠直接或密切接触史。没人确认通过非洲啮齿类感染,也没确认人传人。
  3. 冈比亚巨鼠是猴痘的天然宿主吗?它是最可疑的源头动物之一,货批里的巨鼠检出了病毒。但自然储存宿主这个身份,在非洲生态学上还没定论。
  4. 2003年美国猴痘疫情死了多少人?零死亡。暴发株是低毒力的西非分支,加上美国医疗条件好,71例全部康复。
  5. 美国政府靠什么阻止了宠物贸易传播猴痘?2003年6月11日,CDC与FDA联合禁止非洲啮齿类进口,暂停草原犬鼠州际运输和销售,对涉疫动物实施隔离与扑杀。

参考文献

  1. Reed KD, Melski JW, Graham MB, et al. The detection of monkeypox in humans in the Western Hemisphere. N Engl J Med. 2004;350(4):342-350. DOI: 10.1056/NEJMoa032299
  2. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Update: multistate outbreak of monkeypox: Illinois, Indiana, Kansas, Missouri, Ohio, and Wisconsin, 2003. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2003;52(27):642-646. CDC MMWR 52(27):642-646
  3. Likos AM, Sammons SA, Olson VA, et al. A tale of two clades: monkeypox viruses. J Gen Virol. 2005;86(Pt 10):2661-2672. DOI: 10.1099/vir.0.81215-0
  4. Chen N, Li G, Liszewski MK, et al. Virulence differences between monkeypox virus isolates from West Africa and the Congo basin. Virology. 2005;340(1):46-63. DOI: 10.1016/j.virol.2005.05.030
  5. Guarner J, Johnson BJ, Paddock CD, et al. Monkeypox transmission and pathogenesis in prairie dogs. Emerg Infect Dis. 2004;10(3):426-431. DOI: 10.3201/eid1003.030878
  6. Hutson CL, Lee KN, Abel J, et al. Monkeypox zoonotic associations: insights from laboratory evaluation of animals associated with the multi-state US outbreak. Am J Trop Med Hyg. 2007;76(4):757-768. DOI: 10.4269/ajtmh.2007.76.757
  7. Kile JC, Fleischauer AT, Beard B, et al. Transmission of monkeypox among persons exposed to infected prairie dogs in Indiana in 2003. Arch Pediatr Adolesc Med. 2005;159(11):1022-1025. DOI: 10.1001/archpedi.159.11.1022

引用本案例

基因溯源数据中心. “2003年美国猴痘暴发溯源:冈比亚巨鼠、草原犬鼠与宠物贸易的跨洋传播证据链” 溯源案例研究. https://www.jiyinsuyuan.cn/anli/334.html